Protein–RNA interactions for Protein: Q6SPF0

SAMD1, Atherin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD1Q6SPF0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SAMD1Q6SPF0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SAMD1Q6SPF0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SAMD1Q6SPF0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SAMD1Q6SPF0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SAMD1Q6SPF0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SAMD1Q6SPF0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SAMD1Q6SPF0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SAMD1Q6SPF0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SAMD1Q6SPF0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SAMD1Q6SPF0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SAMD1Q6SPF0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SAMD1Q6SPF0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SAMD1Q6SPF0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SAMD1Q6SPF0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SAMD1Q6SPF0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SAMD1Q6SPF0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SAMD1Q6SPF0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SAMD1Q6SPF0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SAMD1Q6SPF0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SAMD1Q6SPF0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SAMD1Q6SPF0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SAMD1Q6SPF0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SAMD1Q6SPF0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SAMD1Q6SPF0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SAMD1Q6SPF0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SAMD1Q6SPF0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SAMD1Q6SPF0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SAMD1Q6SPF0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SAMD1Q6SPF0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SAMD1Q6SPF0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SAMD1Q6SPF0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SAMD1Q6SPF0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SAMD1Q6SPF0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SAMD1Q6SPF0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SAMD1Q6SPF0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SAMD1Q6SPF0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SAMD1Q6SPF0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SAMD1Q6SPF0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SAMD1Q6SPF0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SAMD1Q6SPF0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SAMD1Q6SPF0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SAMD1Q6SPF0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SAMD1Q6SPF0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SAMD1Q6SPF0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SAMD1Q6SPF0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SAMD1Q6SPF0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SAMD1Q6SPF0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SAMD1Q6SPF0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SAMD1Q6SPF0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SAMD1Q6SPF0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SAMD1Q6SPF0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SAMD1Q6SPF0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SAMD1Q6SPF0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SAMD1Q6SPF0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SAMD1Q6SPF0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SAMD1Q6SPF0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SAMD1Q6SPF0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SAMD1Q6SPF0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SAMD1Q6SPF0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SAMD1Q6SPF0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SAMD1Q6SPF0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SAMD1Q6SPF0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SAMD1Q6SPF0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SAMD1Q6SPF0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SAMD1Q6SPF0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SAMD1Q6SPF0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SAMD1Q6SPF0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SAMD1Q6SPF0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SAMD1Q6SPF0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SAMD1Q6SPF0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SAMD1Q6SPF0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SAMD1Q6SPF0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SAMD1Q6SPF0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SAMD1Q6SPF0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SAMD1Q6SPF0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SAMD1Q6SPF0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
SAMD1Q6SPF0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SAMD1Q6SPF0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SAMD1Q6SPF0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
SAMD1Q6SPF0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SAMD1Q6SPF0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SAMD1Q6SPF0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SAMD1Q6SPF0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SAMD1Q6SPF0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SAMD1Q6SPF0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
SAMD1Q6SPF0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SAMD1Q6SPF0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SAMD1Q6SPF0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SAMD1Q6SPF0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SAMD1Q6SPF0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SAMD1Q6SPF0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SAMD1Q6SPF0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SAMD1Q6SPF0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SAMD1Q6SPF0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SAMD1Q6SPF0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SAMD1Q6SPF0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SAMD1Q6SPF0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SAMD1Q6SPF0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SAMD1Q6SPF0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms