Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIF2

SYCE2, Synaptonemal complex central element protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE2Q6PIF2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYCE2Q6PIF2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYCE2Q6PIF2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYCE2Q6PIF2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYCE2Q6PIF2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYCE2Q6PIF2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYCE2Q6PIF2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYCE2Q6PIF2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYCE2Q6PIF2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYCE2Q6PIF2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYCE2Q6PIF2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYCE2Q6PIF2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYCE2Q6PIF2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYCE2Q6PIF2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYCE2Q6PIF2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SYCE2Q6PIF2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SYCE2Q6PIF2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYCE2Q6PIF2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYCE2Q6PIF2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SYCE2Q6PIF2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYCE2Q6PIF2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SYCE2Q6PIF2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYCE2Q6PIF2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYCE2Q6PIF2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYCE2Q6PIF2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYCE2Q6PIF2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYCE2Q6PIF2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SYCE2Q6PIF2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYCE2Q6PIF2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYCE2Q6PIF2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYCE2Q6PIF2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYCE2Q6PIF2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYCE2Q6PIF2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYCE2Q6PIF2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYCE2Q6PIF2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYCE2Q6PIF2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYCE2Q6PIF2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYCE2Q6PIF2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYCE2Q6PIF2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYCE2Q6PIF2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYCE2Q6PIF2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SYCE2Q6PIF2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYCE2Q6PIF2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYCE2Q6PIF2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SYCE2Q6PIF2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SYCE2Q6PIF2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYCE2Q6PIF2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYCE2Q6PIF2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SYCE2Q6PIF2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYCE2Q6PIF2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYCE2Q6PIF2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYCE2Q6PIF2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYCE2Q6PIF2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYCE2Q6PIF2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SYCE2Q6PIF2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYCE2Q6PIF2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYCE2Q6PIF2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYCE2Q6PIF2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYCE2Q6PIF2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYCE2Q6PIF2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYCE2Q6PIF2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYCE2Q6PIF2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYCE2Q6PIF2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYCE2Q6PIF2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYCE2Q6PIF2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYCE2Q6PIF2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYCE2Q6PIF2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYCE2Q6PIF2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYCE2Q6PIF2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYCE2Q6PIF2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYCE2Q6PIF2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYCE2Q6PIF2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SYCE2Q6PIF2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYCE2Q6PIF2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYCE2Q6PIF2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYCE2Q6PIF2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYCE2Q6PIF2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYCE2Q6PIF2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SYCE2Q6PIF2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYCE2Q6PIF2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYCE2Q6PIF2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYCE2Q6PIF2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYCE2Q6PIF2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYCE2Q6PIF2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYCE2Q6PIF2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYCE2Q6PIF2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYCE2Q6PIF2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCE2Q6PIF2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCE2Q6PIF2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCE2Q6PIF2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCE2Q6PIF2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCE2Q6PIF2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCE2Q6PIF2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCE2Q6PIF2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCE2Q6PIF2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCE2Q6PIF2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCE2Q6PIF2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCE2Q6PIF2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYCE2Q6PIF2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYCE2Q6PIF2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms