Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCD5

RFWD3, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFWD3Q6PCD5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RFWD3Q6PCD5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RFWD3Q6PCD5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RFWD3Q6PCD5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RFWD3Q6PCD5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RFWD3Q6PCD5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RFWD3Q6PCD5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RFWD3Q6PCD5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RFWD3Q6PCD5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RFWD3Q6PCD5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RFWD3Q6PCD5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RFWD3Q6PCD5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RFWD3Q6PCD5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RFWD3Q6PCD5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RFWD3Q6PCD5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RFWD3Q6PCD5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RFWD3Q6PCD5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RFWD3Q6PCD5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RFWD3Q6PCD5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RFWD3Q6PCD5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RFWD3Q6PCD5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RFWD3Q6PCD5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RFWD3Q6PCD5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RFWD3Q6PCD5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RFWD3Q6PCD5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RFWD3Q6PCD5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RFWD3Q6PCD5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RFWD3Q6PCD5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RFWD3Q6PCD5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFWD3Q6PCD5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFWD3Q6PCD5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFWD3Q6PCD5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFWD3Q6PCD5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFWD3Q6PCD5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFWD3Q6PCD5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFWD3Q6PCD5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFWD3Q6PCD5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFWD3Q6PCD5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFWD3Q6PCD5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFWD3Q6PCD5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFWD3Q6PCD5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFWD3Q6PCD5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RFWD3Q6PCD5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RFWD3Q6PCD5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RFWD3Q6PCD5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RFWD3Q6PCD5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RFWD3Q6PCD5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RFWD3Q6PCD5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RFWD3Q6PCD5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RFWD3Q6PCD5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RFWD3Q6PCD5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RFWD3Q6PCD5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RFWD3Q6PCD5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RFWD3Q6PCD5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RFWD3Q6PCD5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RFWD3Q6PCD5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RFWD3Q6PCD5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RFWD3Q6PCD5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RFWD3Q6PCD5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RFWD3Q6PCD5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RFWD3Q6PCD5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RFWD3Q6PCD5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RFWD3Q6PCD5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RFWD3Q6PCD5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RFWD3Q6PCD5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RFWD3Q6PCD5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RFWD3Q6PCD5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RFWD3Q6PCD5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RFWD3Q6PCD5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RFWD3Q6PCD5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RFWD3Q6PCD5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RFWD3Q6PCD5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RFWD3Q6PCD5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RFWD3Q6PCD5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RFWD3Q6PCD5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RFWD3Q6PCD5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RFWD3Q6PCD5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RFWD3Q6PCD5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RFWD3Q6PCD5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RFWD3Q6PCD5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RFWD3Q6PCD5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RFWD3Q6PCD5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RFWD3Q6PCD5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RFWD3Q6PCD5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RFWD3Q6PCD5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RFWD3Q6PCD5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RFWD3Q6PCD5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RFWD3Q6PCD5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RFWD3Q6PCD5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RFWD3Q6PCD5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RFWD3Q6PCD5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RFWD3Q6PCD5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RFWD3Q6PCD5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RFWD3Q6PCD5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RFWD3Q6PCD5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RFWD3Q6PCD5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RFWD3Q6PCD5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RFWD3Q6PCD5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RFWD3Q6PCD5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RFWD3Q6PCD5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms