Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB8

EMB, Embigin, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMBQ6PCB8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EMBQ6PCB8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EMBQ6PCB8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EMBQ6PCB8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
EMBQ6PCB8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
EMBQ6PCB8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
EMBQ6PCB8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EMBQ6PCB8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EMBQ6PCB8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EMBQ6PCB8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EMBQ6PCB8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EMBQ6PCB8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EMBQ6PCB8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EMBQ6PCB8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EMBQ6PCB8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EMBQ6PCB8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EMBQ6PCB8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EMBQ6PCB8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EMBQ6PCB8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EMBQ6PCB8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EMBQ6PCB8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EMBQ6PCB8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EMBQ6PCB8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EMBQ6PCB8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EMBQ6PCB8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EMBQ6PCB8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EMBQ6PCB8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EMBQ6PCB8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EMBQ6PCB8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EMBQ6PCB8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EMBQ6PCB8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EMBQ6PCB8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EMBQ6PCB8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EMBQ6PCB8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EMBQ6PCB8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EMBQ6PCB8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EMBQ6PCB8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EMBQ6PCB8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EMBQ6PCB8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EMBQ6PCB8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EMBQ6PCB8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EMBQ6PCB8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EMBQ6PCB8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EMBQ6PCB8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EMBQ6PCB8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EMBQ6PCB8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EMBQ6PCB8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EMBQ6PCB8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EMBQ6PCB8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EMBQ6PCB8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EMBQ6PCB8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EMBQ6PCB8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EMBQ6PCB8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
EMBQ6PCB8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EMBQ6PCB8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EMBQ6PCB8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EMBQ6PCB8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EMBQ6PCB8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EMBQ6PCB8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EMBQ6PCB8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EMBQ6PCB8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EMBQ6PCB8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EMBQ6PCB8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EMBQ6PCB8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EMBQ6PCB8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EMBQ6PCB8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EMBQ6PCB8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EMBQ6PCB8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EMBQ6PCB8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EMBQ6PCB8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EMBQ6PCB8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EMBQ6PCB8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EMBQ6PCB8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
EMBQ6PCB8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EMBQ6PCB8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EMBQ6PCB8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EMBQ6PCB8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EMBQ6PCB8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EMBQ6PCB8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EMBQ6PCB8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
EMBQ6PCB8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
EMBQ6PCB8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EMBQ6PCB8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EMBQ6PCB8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EMBQ6PCB8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EMBQ6PCB8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EMBQ6PCB8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EMBQ6PCB8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EMBQ6PCB8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EMBQ6PCB8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EMBQ6PCB8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EMBQ6PCB8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
EMBQ6PCB8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EMBQ6PCB8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EMBQ6PCB8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EMBQ6PCB8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EMBQ6PCB8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
EMBQ6PCB8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EMBQ6PCB8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EMBQ6PCB8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms