Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5X5

C22orf39, UPF0545 protein C22orf39, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C22orf39Q6P5X5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C22orf39Q6P5X5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C22orf39Q6P5X5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C22orf39Q6P5X5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
C22orf39Q6P5X5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C22orf39Q6P5X5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C22orf39Q6P5X5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C22orf39Q6P5X5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C22orf39Q6P5X5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C22orf39Q6P5X5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C22orf39Q6P5X5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C22orf39Q6P5X5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C22orf39Q6P5X5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C22orf39Q6P5X5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
C22orf39Q6P5X5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C22orf39Q6P5X5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C22orf39Q6P5X5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C22orf39Q6P5X5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C22orf39Q6P5X5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C22orf39Q6P5X5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C22orf39Q6P5X5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C22orf39Q6P5X5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C22orf39Q6P5X5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C22orf39Q6P5X5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C22orf39Q6P5X5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C22orf39Q6P5X5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C22orf39Q6P5X5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C22orf39Q6P5X5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
C22orf39Q6P5X5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
C22orf39Q6P5X5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
C22orf39Q6P5X5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
C22orf39Q6P5X5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
C22orf39Q6P5X5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C22orf39Q6P5X5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C22orf39Q6P5X5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
C22orf39Q6P5X5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C22orf39Q6P5X5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C22orf39Q6P5X5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C22orf39Q6P5X5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C22orf39Q6P5X5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
C22orf39Q6P5X5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C22orf39Q6P5X5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C22orf39Q6P5X5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C22orf39Q6P5X5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C22orf39Q6P5X5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
C22orf39Q6P5X5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C22orf39Q6P5X5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C22orf39Q6P5X5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C22orf39Q6P5X5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C22orf39Q6P5X5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C22orf39Q6P5X5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C22orf39Q6P5X5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C22orf39Q6P5X5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C22orf39Q6P5X5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C22orf39Q6P5X5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C22orf39Q6P5X5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C22orf39Q6P5X5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C22orf39Q6P5X5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C22orf39Q6P5X5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C22orf39Q6P5X5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C22orf39Q6P5X5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C22orf39Q6P5X5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C22orf39Q6P5X5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C22orf39Q6P5X5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C22orf39Q6P5X5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C22orf39Q6P5X5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C22orf39Q6P5X5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C22orf39Q6P5X5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C22orf39Q6P5X5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C22orf39Q6P5X5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C22orf39Q6P5X5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C22orf39Q6P5X5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C22orf39Q6P5X5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
C22orf39Q6P5X5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C22orf39Q6P5X5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C22orf39Q6P5X5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C22orf39Q6P5X5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C22orf39Q6P5X5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C22orf39Q6P5X5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24■■□□□ 1.43
C22orf39Q6P5X5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24■■□□□ 1.43
C22orf39Q6P5X5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
C22orf39Q6P5X5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C22orf39Q6P5X5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C22orf39Q6P5X5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C22orf39Q6P5X5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
C22orf39Q6P5X5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C22orf39Q6P5X5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C22orf39Q6P5X5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
C22orf39Q6P5X5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C22orf39Q6P5X5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C22orf39Q6P5X5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C22orf39Q6P5X5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C22orf39Q6P5X5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C22orf39Q6P5X5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C22orf39Q6P5X5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C22orf39Q6P5X5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C22orf39Q6P5X5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C22orf39Q6P5X5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C22orf39Q6P5X5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C22orf39Q6P5X5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms