Protein–RNA interactions for Protein: Q6NYC8

PPP1R18, Phostensin, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R18Q6NYC8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PPP1R18Q6NYC8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PPP1R18Q6NYC8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PPP1R18Q6NYC8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PPP1R18Q6NYC8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PPP1R18Q6NYC8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PPP1R18Q6NYC8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PPP1R18Q6NYC8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PPP1R18Q6NYC8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
PPP1R18Q6NYC8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PPP1R18Q6NYC8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PPP1R18Q6NYC8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PPP1R18Q6NYC8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PPP1R18Q6NYC8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PPP1R18Q6NYC8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PPP1R18Q6NYC8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PPP1R18Q6NYC8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PPP1R18Q6NYC8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PPP1R18Q6NYC8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PPP1R18Q6NYC8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PPP1R18Q6NYC8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PPP1R18Q6NYC8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PPP1R18Q6NYC8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PPP1R18Q6NYC8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PPP1R18Q6NYC8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PPP1R18Q6NYC8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PPP1R18Q6NYC8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PPP1R18Q6NYC8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PPP1R18Q6NYC8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PPP1R18Q6NYC8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PPP1R18Q6NYC8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PPP1R18Q6NYC8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PPP1R18Q6NYC8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PPP1R18Q6NYC8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PPP1R18Q6NYC8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PPP1R18Q6NYC8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PPP1R18Q6NYC8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PPP1R18Q6NYC8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PPP1R18Q6NYC8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PPP1R18Q6NYC8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PPP1R18Q6NYC8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PPP1R18Q6NYC8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PPP1R18Q6NYC8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PPP1R18Q6NYC8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
PPP1R18Q6NYC8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PPP1R18Q6NYC8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PPP1R18Q6NYC8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PPP1R18Q6NYC8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PPP1R18Q6NYC8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PPP1R18Q6NYC8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PPP1R18Q6NYC8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PPP1R18Q6NYC8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PPP1R18Q6NYC8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PPP1R18Q6NYC8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PPP1R18Q6NYC8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PPP1R18Q6NYC8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PPP1R18Q6NYC8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PPP1R18Q6NYC8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PPP1R18Q6NYC8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PPP1R18Q6NYC8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PPP1R18Q6NYC8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PPP1R18Q6NYC8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PPP1R18Q6NYC8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PPP1R18Q6NYC8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PPP1R18Q6NYC8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PPP1R18Q6NYC8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PPP1R18Q6NYC8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PPP1R18Q6NYC8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PPP1R18Q6NYC8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PPP1R18Q6NYC8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PPP1R18Q6NYC8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PPP1R18Q6NYC8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PPP1R18Q6NYC8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PPP1R18Q6NYC8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PPP1R18Q6NYC8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PPP1R18Q6NYC8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PPP1R18Q6NYC8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PPP1R18Q6NYC8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PPP1R18Q6NYC8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PPP1R18Q6NYC8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PPP1R18Q6NYC8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PPP1R18Q6NYC8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PPP1R18Q6NYC8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PPP1R18Q6NYC8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PPP1R18Q6NYC8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PPP1R18Q6NYC8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PPP1R18Q6NYC8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PPP1R18Q6NYC8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PPP1R18Q6NYC8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PPP1R18Q6NYC8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PPP1R18Q6NYC8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PPP1R18Q6NYC8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PPP1R18Q6NYC8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PPP1R18Q6NYC8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PPP1R18Q6NYC8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PPP1R18Q6NYC8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PPP1R18Q6NYC8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PPP1R18Q6NYC8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PPP1R18Q6NYC8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PPP1R18Q6NYC8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms