Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ANKRD54Q6NXT1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ANKRD54Q6NXT1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ANKRD54Q6NXT1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ANKRD54Q6NXT1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ANKRD54Q6NXT1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ANKRD54Q6NXT1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ANKRD54Q6NXT1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ANKRD54Q6NXT1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ANKRD54Q6NXT1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ANKRD54Q6NXT1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ANKRD54Q6NXT1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ANKRD54Q6NXT1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ANKRD54Q6NXT1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ANKRD54Q6NXT1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ANKRD54Q6NXT1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ANKRD54Q6NXT1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ANKRD54Q6NXT1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ANKRD54Q6NXT1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ANKRD54Q6NXT1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ANKRD54Q6NXT1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ANKRD54Q6NXT1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ANKRD54Q6NXT1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ANKRD54Q6NXT1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ANKRD54Q6NXT1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ANKRD54Q6NXT1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ANKRD54Q6NXT1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ANKRD54Q6NXT1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ANKRD54Q6NXT1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ANKRD54Q6NXT1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ANKRD54Q6NXT1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ANKRD54Q6NXT1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ANKRD54Q6NXT1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ANKRD54Q6NXT1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ANKRD54Q6NXT1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ANKRD54Q6NXT1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ANKRD54Q6NXT1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ANKRD54Q6NXT1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ANKRD54Q6NXT1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ANKRD54Q6NXT1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ANKRD54Q6NXT1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ANKRD54Q6NXT1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ANKRD54Q6NXT1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ANKRD54Q6NXT1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ANKRD54Q6NXT1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ANKRD54Q6NXT1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ANKRD54Q6NXT1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ANKRD54Q6NXT1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
ANKRD54Q6NXT1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ANKRD54Q6NXT1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ANKRD54Q6NXT1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ANKRD54Q6NXT1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ANKRD54Q6NXT1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ANKRD54Q6NXT1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ANKRD54Q6NXT1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ANKRD54Q6NXT1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ANKRD54Q6NXT1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ANKRD54Q6NXT1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ANKRD54Q6NXT1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ANKRD54Q6NXT1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ANKRD54Q6NXT1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ANKRD54Q6NXT1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ANKRD54Q6NXT1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ANKRD54Q6NXT1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ANKRD54Q6NXT1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ANKRD54Q6NXT1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ANKRD54Q6NXT1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ANKRD54Q6NXT1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ANKRD54Q6NXT1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ANKRD54Q6NXT1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ANKRD54Q6NXT1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ANKRD54Q6NXT1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ANKRD54Q6NXT1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ANKRD54Q6NXT1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ANKRD54Q6NXT1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ANKRD54Q6NXT1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ANKRD54Q6NXT1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ANKRD54Q6NXT1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ANKRD54Q6NXT1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ANKRD54Q6NXT1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ANKRD54Q6NXT1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ANKRD54Q6NXT1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ANKRD54Q6NXT1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ANKRD54Q6NXT1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ANKRD54Q6NXT1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ANKRD54Q6NXT1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ANKRD54Q6NXT1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ANKRD54Q6NXT1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ANKRD54Q6NXT1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ANKRD54Q6NXT1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ANKRD54Q6NXT1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ANKRD54Q6NXT1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ANKRD54Q6NXT1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ANKRD54Q6NXT1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ANKRD54Q6NXT1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ANKRD54Q6NXT1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ANKRD54Q6NXT1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ANKRD54Q6NXT1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ANKRD54Q6NXT1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ANKRD54Q6NXT1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms