Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWY9

PRPF40B, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40BQ6NWY9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
PRPF40BQ6NWY9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
PRPF40BQ6NWY9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PRPF40BQ6NWY9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PRPF40BQ6NWY9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PRPF40BQ6NWY9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PRPF40BQ6NWY9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PRPF40BQ6NWY9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PRPF40BQ6NWY9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PRPF40BQ6NWY9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PRPF40BQ6NWY9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PRPF40BQ6NWY9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PRPF40BQ6NWY9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PRPF40BQ6NWY9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PRPF40BQ6NWY9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PRPF40BQ6NWY9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PRPF40BQ6NWY9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PRPF40BQ6NWY9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PRPF40BQ6NWY9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PRPF40BQ6NWY9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PRPF40BQ6NWY9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PRPF40BQ6NWY9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PRPF40BQ6NWY9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PRPF40BQ6NWY9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PRPF40BQ6NWY9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PRPF40BQ6NWY9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PRPF40BQ6NWY9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PRPF40BQ6NWY9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PRPF40BQ6NWY9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRPF40BQ6NWY9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRPF40BQ6NWY9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRPF40BQ6NWY9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRPF40BQ6NWY9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRPF40BQ6NWY9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PRPF40BQ6NWY9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PRPF40BQ6NWY9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PRPF40BQ6NWY9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PRPF40BQ6NWY9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PRPF40BQ6NWY9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
PRPF40BQ6NWY9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PRPF40BQ6NWY9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PRPF40BQ6NWY9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PRPF40BQ6NWY9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PRPF40BQ6NWY9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PRPF40BQ6NWY9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PRPF40BQ6NWY9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
PRPF40BQ6NWY9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRPF40BQ6NWY9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRPF40BQ6NWY9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRPF40BQ6NWY9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
PRPF40BQ6NWY9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PRPF40BQ6NWY9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PRPF40BQ6NWY9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PRPF40BQ6NWY9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PRPF40BQ6NWY9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PRPF40BQ6NWY9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PRPF40BQ6NWY9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PRPF40BQ6NWY9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PRPF40BQ6NWY9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
PRPF40BQ6NWY9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PRPF40BQ6NWY9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PRPF40BQ6NWY9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PRPF40BQ6NWY9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PRPF40BQ6NWY9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PRPF40BQ6NWY9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PRPF40BQ6NWY9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PRPF40BQ6NWY9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PRPF40BQ6NWY9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PRPF40BQ6NWY9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PRPF40BQ6NWY9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PRPF40BQ6NWY9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRPF40BQ6NWY9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRPF40BQ6NWY9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRPF40BQ6NWY9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRPF40BQ6NWY9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRPF40BQ6NWY9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRPF40BQ6NWY9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRPF40BQ6NWY9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PRPF40BQ6NWY9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PRPF40BQ6NWY9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
PRPF40BQ6NWY9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PRPF40BQ6NWY9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PRPF40BQ6NWY9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PRPF40BQ6NWY9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PRPF40BQ6NWY9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PRPF40BQ6NWY9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PRPF40BQ6NWY9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
PRPF40BQ6NWY9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PRPF40BQ6NWY9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PRPF40BQ6NWY9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PRPF40BQ6NWY9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PRPF40BQ6NWY9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRPF40BQ6NWY9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRPF40BQ6NWY9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRPF40BQ6NWY9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRPF40BQ6NWY9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRPF40BQ6NWY9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRPF40BQ6NWY9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
PRPF40BQ6NWY9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRPF40BQ6NWY9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms