Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVU6

UFSP1, Inactive Ufm1-specific protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFSP1Q6NVU6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UFSP1Q6NVU6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UFSP1Q6NVU6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UFSP1Q6NVU6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UFSP1Q6NVU6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UFSP1Q6NVU6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UFSP1Q6NVU6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UFSP1Q6NVU6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UFSP1Q6NVU6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UFSP1Q6NVU6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UFSP1Q6NVU6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UFSP1Q6NVU6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UFSP1Q6NVU6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UFSP1Q6NVU6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UFSP1Q6NVU6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UFSP1Q6NVU6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UFSP1Q6NVU6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UFSP1Q6NVU6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UFSP1Q6NVU6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UFSP1Q6NVU6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UFSP1Q6NVU6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
UFSP1Q6NVU6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UFSP1Q6NVU6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UFSP1Q6NVU6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UFSP1Q6NVU6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UFSP1Q6NVU6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UFSP1Q6NVU6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UFSP1Q6NVU6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
UFSP1Q6NVU6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UFSP1Q6NVU6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UFSP1Q6NVU6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UFSP1Q6NVU6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UFSP1Q6NVU6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UFSP1Q6NVU6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UFSP1Q6NVU6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UFSP1Q6NVU6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UFSP1Q6NVU6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UFSP1Q6NVU6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UFSP1Q6NVU6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UFSP1Q6NVU6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UFSP1Q6NVU6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UFSP1Q6NVU6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UFSP1Q6NVU6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UFSP1Q6NVU6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UFSP1Q6NVU6 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UFSP1Q6NVU6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UFSP1Q6NVU6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UFSP1Q6NVU6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UFSP1Q6NVU6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UFSP1Q6NVU6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UFSP1Q6NVU6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UFSP1Q6NVU6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UFSP1Q6NVU6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UFSP1Q6NVU6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UFSP1Q6NVU6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UFSP1Q6NVU6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
UFSP1Q6NVU6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UFSP1Q6NVU6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UFSP1Q6NVU6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UFSP1Q6NVU6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UFSP1Q6NVU6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UFSP1Q6NVU6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UFSP1Q6NVU6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UFSP1Q6NVU6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UFSP1Q6NVU6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UFSP1Q6NVU6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UFSP1Q6NVU6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UFSP1Q6NVU6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UFSP1Q6NVU6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UFSP1Q6NVU6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UFSP1Q6NVU6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UFSP1Q6NVU6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UFSP1Q6NVU6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UFSP1Q6NVU6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
UFSP1Q6NVU6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
UFSP1Q6NVU6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UFSP1Q6NVU6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UFSP1Q6NVU6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UFSP1Q6NVU6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UFSP1Q6NVU6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UFSP1Q6NVU6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UFSP1Q6NVU6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UFSP1Q6NVU6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
UFSP1Q6NVU6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UFSP1Q6NVU6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UFSP1Q6NVU6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UFSP1Q6NVU6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UFSP1Q6NVU6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UFSP1Q6NVU6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UFSP1Q6NVU6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UFSP1Q6NVU6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UFSP1Q6NVU6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UFSP1Q6NVU6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UFSP1Q6NVU6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UFSP1Q6NVU6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UFSP1Q6NVU6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UFSP1Q6NVU6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UFSP1Q6NVU6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UFSP1Q6NVU6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UFSP1Q6NVU6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms