Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT80Q6KB66 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT80Q6KB66 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT80Q6KB66 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT80Q6KB66 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT80Q6KB66 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT80Q6KB66 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT80Q6KB66 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT80Q6KB66 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT80Q6KB66 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT80Q6KB66 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT80Q6KB66 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT80Q6KB66 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT80Q6KB66 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT80Q6KB66 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT80Q6KB66 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT80Q6KB66 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT80Q6KB66 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT80Q6KB66 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT80Q6KB66 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT80Q6KB66 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT80Q6KB66 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT80Q6KB66 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT80Q6KB66 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT80Q6KB66 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT80Q6KB66 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT80Q6KB66 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT80Q6KB66 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT80Q6KB66 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT80Q6KB66 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT80Q6KB66 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT80Q6KB66 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT80Q6KB66 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT80Q6KB66 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT80Q6KB66 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT80Q6KB66 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT80Q6KB66 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT80Q6KB66 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT80Q6KB66 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
KRT80Q6KB66 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
KRT80Q6KB66 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
KRT80Q6KB66 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT80Q6KB66 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT80Q6KB66 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT80Q6KB66 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT80Q6KB66 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT80Q6KB66 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT80Q6KB66 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT80Q6KB66 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT80Q6KB66 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT80Q6KB66 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT80Q6KB66 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT80Q6KB66 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT80Q6KB66 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT80Q6KB66 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT80Q6KB66 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT80Q6KB66 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT80Q6KB66 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT80Q6KB66 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT80Q6KB66 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT80Q6KB66 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT80Q6KB66 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT80Q6KB66 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT80Q6KB66 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT80Q6KB66 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT80Q6KB66 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT80Q6KB66 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT80Q6KB66 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT80Q6KB66 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT80Q6KB66 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT80Q6KB66 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT80Q6KB66 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT80Q6KB66 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT80Q6KB66 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT80Q6KB66 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT80Q6KB66 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT80Q6KB66 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT80Q6KB66 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT80Q6KB66 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT80Q6KB66 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT80Q6KB66 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT80Q6KB66 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT80Q6KB66 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT80Q6KB66 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT80Q6KB66 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT80Q6KB66 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT80Q6KB66 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT80Q6KB66 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT80Q6KB66 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT80Q6KB66 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT80Q6KB66 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT80Q6KB66 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT80Q6KB66 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT80Q6KB66 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT80Q6KB66 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT80Q6KB66 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT80Q6KB66 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT80Q6KB66 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT80Q6KB66 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT80Q6KB66 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms