Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE6

LCN10, Epididymal-specific lipocalin-10, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN10Q6JVE6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LCN10Q6JVE6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LCN10Q6JVE6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LCN10Q6JVE6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LCN10Q6JVE6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LCN10Q6JVE6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LCN10Q6JVE6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LCN10Q6JVE6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LCN10Q6JVE6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LCN10Q6JVE6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LCN10Q6JVE6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LCN10Q6JVE6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LCN10Q6JVE6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LCN10Q6JVE6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LCN10Q6JVE6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LCN10Q6JVE6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LCN10Q6JVE6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LCN10Q6JVE6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LCN10Q6JVE6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LCN10Q6JVE6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LCN10Q6JVE6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LCN10Q6JVE6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LCN10Q6JVE6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCN10Q6JVE6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCN10Q6JVE6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCN10Q6JVE6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCN10Q6JVE6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCN10Q6JVE6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCN10Q6JVE6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCN10Q6JVE6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCN10Q6JVE6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCN10Q6JVE6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCN10Q6JVE6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCN10Q6JVE6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCN10Q6JVE6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LCN10Q6JVE6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCN10Q6JVE6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LCN10Q6JVE6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LCN10Q6JVE6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LCN10Q6JVE6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LCN10Q6JVE6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LCN10Q6JVE6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LCN10Q6JVE6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LCN10Q6JVE6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LCN10Q6JVE6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LCN10Q6JVE6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LCN10Q6JVE6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LCN10Q6JVE6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LCN10Q6JVE6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LCN10Q6JVE6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LCN10Q6JVE6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LCN10Q6JVE6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LCN10Q6JVE6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LCN10Q6JVE6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LCN10Q6JVE6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LCN10Q6JVE6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCN10Q6JVE6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCN10Q6JVE6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCN10Q6JVE6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCN10Q6JVE6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCN10Q6JVE6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LCN10Q6JVE6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCN10Q6JVE6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCN10Q6JVE6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LCN10Q6JVE6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LCN10Q6JVE6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LCN10Q6JVE6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LCN10Q6JVE6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LCN10Q6JVE6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LCN10Q6JVE6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCN10Q6JVE6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCN10Q6JVE6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCN10Q6JVE6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCN10Q6JVE6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LCN10Q6JVE6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCN10Q6JVE6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCN10Q6JVE6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCN10Q6JVE6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCN10Q6JVE6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LCN10Q6JVE6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LCN10Q6JVE6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LCN10Q6JVE6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LCN10Q6JVE6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LCN10Q6JVE6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LCN10Q6JVE6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LCN10Q6JVE6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LCN10Q6JVE6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LCN10Q6JVE6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LCN10Q6JVE6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCN10Q6JVE6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCN10Q6JVE6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCN10Q6JVE6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCN10Q6JVE6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCN10Q6JVE6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCN10Q6JVE6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCN10Q6JVE6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCN10Q6JVE6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCN10Q6JVE6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LCN10Q6JVE6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LCN10Q6JVE6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms