Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MCTP1Q6DN14 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MCTP1Q6DN14 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MCTP1Q6DN14 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
MCTP1Q6DN14 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MCTP1Q6DN14 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MCTP1Q6DN14 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MCTP1Q6DN14 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MCTP1Q6DN14 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MCTP1Q6DN14 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
MCTP1Q6DN14 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MCTP1Q6DN14 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MCTP1Q6DN14 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MCTP1Q6DN14 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MCTP1Q6DN14 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MCTP1Q6DN14 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MCTP1Q6DN14 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
MCTP1Q6DN14 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
MCTP1Q6DN14 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MCTP1Q6DN14 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MCTP1Q6DN14 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
MCTP1Q6DN14 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MCTP1Q6DN14 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MCTP1Q6DN14 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MCTP1Q6DN14 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MCTP1Q6DN14 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MCTP1Q6DN14 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MCTP1Q6DN14 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MCTP1Q6DN14 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MCTP1Q6DN14 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MCTP1Q6DN14 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MCTP1Q6DN14 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MCTP1Q6DN14 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MCTP1Q6DN14 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MCTP1Q6DN14 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MCTP1Q6DN14 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MCTP1Q6DN14 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MCTP1Q6DN14 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MCTP1Q6DN14 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MCTP1Q6DN14 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MCTP1Q6DN14 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MCTP1Q6DN14 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MCTP1Q6DN14 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MCTP1Q6DN14 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MCTP1Q6DN14 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MCTP1Q6DN14 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MCTP1Q6DN14 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MCTP1Q6DN14 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MCTP1Q6DN14 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MCTP1Q6DN14 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MCTP1Q6DN14 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MCTP1Q6DN14 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MCTP1Q6DN14 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MCTP1Q6DN14 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MCTP1Q6DN14 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MCTP1Q6DN14 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MCTP1Q6DN14 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MCTP1Q6DN14 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MCTP1Q6DN14 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MCTP1Q6DN14 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MCTP1Q6DN14 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MCTP1Q6DN14 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MCTP1Q6DN14 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MCTP1Q6DN14 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MCTP1Q6DN14 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MCTP1Q6DN14 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MCTP1Q6DN14 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MCTP1Q6DN14 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
MCTP1Q6DN14 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MCTP1Q6DN14 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MCTP1Q6DN14 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MCTP1Q6DN14 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MCTP1Q6DN14 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MCTP1Q6DN14 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MCTP1Q6DN14 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MCTP1Q6DN14 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MCTP1Q6DN14 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MCTP1Q6DN14 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MCTP1Q6DN14 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MCTP1Q6DN14 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MCTP1Q6DN14 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MCTP1Q6DN14 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MCTP1Q6DN14 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MCTP1Q6DN14 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MCTP1Q6DN14 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
MCTP1Q6DN14 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MCTP1Q6DN14 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MCTP1Q6DN14 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MCTP1Q6DN14 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MCTP1Q6DN14 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
MCTP1Q6DN14 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MCTP1Q6DN14 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MCTP1Q6DN14 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MCTP1Q6DN14 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
MCTP1Q6DN14 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MCTP1Q6DN14 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MCTP1Q6DN14 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MCTP1Q6DN14 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MCTP1Q6DN14 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
MCTP1Q6DN14 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms