Protein–RNA interactions for Protein: Q6A555

TXNDC8, Thioredoxin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC8Q6A555 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TXNDC8Q6A555 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TXNDC8Q6A555 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TXNDC8Q6A555 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TXNDC8Q6A555 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TXNDC8Q6A555 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TXNDC8Q6A555 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TXNDC8Q6A555 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TXNDC8Q6A555 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TXNDC8Q6A555 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TXNDC8Q6A555 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TXNDC8Q6A555 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TXNDC8Q6A555 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TXNDC8Q6A555 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TXNDC8Q6A555 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TXNDC8Q6A555 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TXNDC8Q6A555 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TXNDC8Q6A555 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TXNDC8Q6A555 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TXNDC8Q6A555 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TXNDC8Q6A555 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TXNDC8Q6A555 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TXNDC8Q6A555 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TXNDC8Q6A555 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TXNDC8Q6A555 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TXNDC8Q6A555 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TXNDC8Q6A555 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TXNDC8Q6A555 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TXNDC8Q6A555 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TXNDC8Q6A555 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TXNDC8Q6A555 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TXNDC8Q6A555 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TXNDC8Q6A555 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TXNDC8Q6A555 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TXNDC8Q6A555 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TXNDC8Q6A555 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TXNDC8Q6A555 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TXNDC8Q6A555 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TXNDC8Q6A555 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TXNDC8Q6A555 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TXNDC8Q6A555 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TXNDC8Q6A555 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TXNDC8Q6A555 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TXNDC8Q6A555 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TXNDC8Q6A555 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TXNDC8Q6A555 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TXNDC8Q6A555 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TXNDC8Q6A555 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TXNDC8Q6A555 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TXNDC8Q6A555 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TXNDC8Q6A555 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TXNDC8Q6A555 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TXNDC8Q6A555 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TXNDC8Q6A555 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TXNDC8Q6A555 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TXNDC8Q6A555 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TXNDC8Q6A555 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TXNDC8Q6A555 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TXNDC8Q6A555 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TXNDC8Q6A555 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TXNDC8Q6A555 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TXNDC8Q6A555 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TXNDC8Q6A555 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TXNDC8Q6A555 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TXNDC8Q6A555 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TXNDC8Q6A555 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TXNDC8Q6A555 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TXNDC8Q6A555 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TXNDC8Q6A555 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TXNDC8Q6A555 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TXNDC8Q6A555 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TXNDC8Q6A555 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TXNDC8Q6A555 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TXNDC8Q6A555 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TXNDC8Q6A555 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TXNDC8Q6A555 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TXNDC8Q6A555 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TXNDC8Q6A555 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TXNDC8Q6A555 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TXNDC8Q6A555 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TXNDC8Q6A555 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TXNDC8Q6A555 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TXNDC8Q6A555 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TXNDC8Q6A555 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TXNDC8Q6A555 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TXNDC8Q6A555 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TXNDC8Q6A555 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TXNDC8Q6A555 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TXNDC8Q6A555 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TXNDC8Q6A555 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TXNDC8Q6A555 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TXNDC8Q6A555 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TXNDC8Q6A555 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TXNDC8Q6A555 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TXNDC8Q6A555 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TXNDC8Q6A555 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TXNDC8Q6A555 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TXNDC8Q6A555 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TXNDC8Q6A555 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TXNDC8Q6A555 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms