Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SLX4IPQ5VYV7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLX4IPQ5VYV7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLX4IPQ5VYV7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLX4IPQ5VYV7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLX4IPQ5VYV7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLX4IPQ5VYV7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLX4IPQ5VYV7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SLX4IPQ5VYV7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLX4IPQ5VYV7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLX4IPQ5VYV7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLX4IPQ5VYV7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLX4IPQ5VYV7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLX4IPQ5VYV7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLX4IPQ5VYV7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLX4IPQ5VYV7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLX4IPQ5VYV7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLX4IPQ5VYV7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLX4IPQ5VYV7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLX4IPQ5VYV7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLX4IPQ5VYV7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLX4IPQ5VYV7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLX4IPQ5VYV7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLX4IPQ5VYV7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLX4IPQ5VYV7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLX4IPQ5VYV7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLX4IPQ5VYV7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLX4IPQ5VYV7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLX4IPQ5VYV7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLX4IPQ5VYV7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLX4IPQ5VYV7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLX4IPQ5VYV7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLX4IPQ5VYV7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLX4IPQ5VYV7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLX4IPQ5VYV7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLX4IPQ5VYV7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLX4IPQ5VYV7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLX4IPQ5VYV7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLX4IPQ5VYV7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLX4IPQ5VYV7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLX4IPQ5VYV7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLX4IPQ5VYV7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLX4IPQ5VYV7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLX4IPQ5VYV7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLX4IPQ5VYV7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLX4IPQ5VYV7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLX4IPQ5VYV7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLX4IPQ5VYV7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLX4IPQ5VYV7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLX4IPQ5VYV7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLX4IPQ5VYV7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLX4IPQ5VYV7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLX4IPQ5VYV7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLX4IPQ5VYV7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLX4IPQ5VYV7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLX4IPQ5VYV7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLX4IPQ5VYV7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLX4IPQ5VYV7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLX4IPQ5VYV7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SLX4IPQ5VYV7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SLX4IPQ5VYV7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SLX4IPQ5VYV7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLX4IPQ5VYV7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SLX4IPQ5VYV7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLX4IPQ5VYV7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLX4IPQ5VYV7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLX4IPQ5VYV7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLX4IPQ5VYV7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLX4IPQ5VYV7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLX4IPQ5VYV7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLX4IPQ5VYV7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLX4IPQ5VYV7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLX4IPQ5VYV7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLX4IPQ5VYV7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLX4IPQ5VYV7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLX4IPQ5VYV7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLX4IPQ5VYV7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLX4IPQ5VYV7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLX4IPQ5VYV7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLX4IPQ5VYV7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLX4IPQ5VYV7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLX4IPQ5VYV7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLX4IPQ5VYV7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLX4IPQ5VYV7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLX4IPQ5VYV7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLX4IPQ5VYV7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLX4IPQ5VYV7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLX4IPQ5VYV7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLX4IPQ5VYV7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLX4IPQ5VYV7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLX4IPQ5VYV7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLX4IPQ5VYV7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLX4IPQ5VYV7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLX4IPQ5VYV7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLX4IPQ5VYV7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLX4IPQ5VYV7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLX4IPQ5VYV7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLX4IPQ5VYV7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLX4IPQ5VYV7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLX4IPQ5VYV7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms