Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX52

SPATA1, Spermatogenesis-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA1Q5VX52 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPATA1Q5VX52 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPATA1Q5VX52 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SPATA1Q5VX52 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPATA1Q5VX52 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPATA1Q5VX52 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPATA1Q5VX52 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPATA1Q5VX52 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPATA1Q5VX52 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SPATA1Q5VX52 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPATA1Q5VX52 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPATA1Q5VX52 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SPATA1Q5VX52 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPATA1Q5VX52 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SPATA1Q5VX52 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPATA1Q5VX52 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPATA1Q5VX52 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPATA1Q5VX52 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SPATA1Q5VX52 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SPATA1Q5VX52 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SPATA1Q5VX52 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SPATA1Q5VX52 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SPATA1Q5VX52 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SPATA1Q5VX52 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPATA1Q5VX52 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPATA1Q5VX52 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPATA1Q5VX52 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPATA1Q5VX52 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPATA1Q5VX52 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPATA1Q5VX52 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SPATA1Q5VX52 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPATA1Q5VX52 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SPATA1Q5VX52 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SPATA1Q5VX52 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SPATA1Q5VX52 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SPATA1Q5VX52 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SPATA1Q5VX52 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SPATA1Q5VX52 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SPATA1Q5VX52 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SPATA1Q5VX52 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SPATA1Q5VX52 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SPATA1Q5VX52 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SPATA1Q5VX52 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SPATA1Q5VX52 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SPATA1Q5VX52 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SPATA1Q5VX52 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SPATA1Q5VX52 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SPATA1Q5VX52 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SPATA1Q5VX52 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SPATA1Q5VX52 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SPATA1Q5VX52 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SPATA1Q5VX52 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SPATA1Q5VX52 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SPATA1Q5VX52 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SPATA1Q5VX52 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SPATA1Q5VX52 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SPATA1Q5VX52 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SPATA1Q5VX52 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SPATA1Q5VX52 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SPATA1Q5VX52 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SPATA1Q5VX52 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SPATA1Q5VX52 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SPATA1Q5VX52 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SPATA1Q5VX52 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SPATA1Q5VX52 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SPATA1Q5VX52 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SPATA1Q5VX52 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SPATA1Q5VX52 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SPATA1Q5VX52 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPATA1Q5VX52 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPATA1Q5VX52 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPATA1Q5VX52 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPATA1Q5VX52 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPATA1Q5VX52 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPATA1Q5VX52 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPATA1Q5VX52 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPATA1Q5VX52 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPATA1Q5VX52 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPATA1Q5VX52 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPATA1Q5VX52 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPATA1Q5VX52 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SPATA1Q5VX52 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SPATA1Q5VX52 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SPATA1Q5VX52 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SPATA1Q5VX52 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SPATA1Q5VX52 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SPATA1Q5VX52 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SPATA1Q5VX52 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SPATA1Q5VX52 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SPATA1Q5VX52 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SPATA1Q5VX52 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SPATA1Q5VX52 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SPATA1Q5VX52 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SPATA1Q5VX52 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SPATA1Q5VX52 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SPATA1Q5VX52 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SPATA1Q5VX52 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SPATA1Q5VX52 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SPATA1Q5VX52 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SPATA1Q5VX52 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms