Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVQ6

YOD1, Ubiquitin thioesterase OTU1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YOD1Q5VVQ6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
YOD1Q5VVQ6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
YOD1Q5VVQ6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
YOD1Q5VVQ6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
YOD1Q5VVQ6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
YOD1Q5VVQ6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
YOD1Q5VVQ6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
YOD1Q5VVQ6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
YOD1Q5VVQ6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
YOD1Q5VVQ6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
YOD1Q5VVQ6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
YOD1Q5VVQ6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
YOD1Q5VVQ6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
YOD1Q5VVQ6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
YOD1Q5VVQ6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
YOD1Q5VVQ6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
YOD1Q5VVQ6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
YOD1Q5VVQ6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
YOD1Q5VVQ6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
YOD1Q5VVQ6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
YOD1Q5VVQ6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
YOD1Q5VVQ6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
YOD1Q5VVQ6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
YOD1Q5VVQ6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
YOD1Q5VVQ6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
YOD1Q5VVQ6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
YOD1Q5VVQ6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
YOD1Q5VVQ6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
YOD1Q5VVQ6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
YOD1Q5VVQ6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
YOD1Q5VVQ6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
YOD1Q5VVQ6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
YOD1Q5VVQ6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
YOD1Q5VVQ6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
YOD1Q5VVQ6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
YOD1Q5VVQ6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
YOD1Q5VVQ6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
YOD1Q5VVQ6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
YOD1Q5VVQ6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
YOD1Q5VVQ6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
YOD1Q5VVQ6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
YOD1Q5VVQ6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
YOD1Q5VVQ6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
YOD1Q5VVQ6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
YOD1Q5VVQ6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
YOD1Q5VVQ6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
YOD1Q5VVQ6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
YOD1Q5VVQ6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
YOD1Q5VVQ6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
YOD1Q5VVQ6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
YOD1Q5VVQ6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
YOD1Q5VVQ6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
YOD1Q5VVQ6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
YOD1Q5VVQ6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
YOD1Q5VVQ6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
YOD1Q5VVQ6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
YOD1Q5VVQ6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
YOD1Q5VVQ6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
YOD1Q5VVQ6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
YOD1Q5VVQ6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
YOD1Q5VVQ6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
YOD1Q5VVQ6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
YOD1Q5VVQ6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
YOD1Q5VVQ6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
YOD1Q5VVQ6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
YOD1Q5VVQ6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
YOD1Q5VVQ6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
YOD1Q5VVQ6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
YOD1Q5VVQ6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
YOD1Q5VVQ6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YOD1Q5VVQ6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
YOD1Q5VVQ6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
YOD1Q5VVQ6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YOD1Q5VVQ6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YOD1Q5VVQ6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YOD1Q5VVQ6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YOD1Q5VVQ6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YOD1Q5VVQ6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
YOD1Q5VVQ6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
YOD1Q5VVQ6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
YOD1Q5VVQ6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
YOD1Q5VVQ6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
YOD1Q5VVQ6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
YOD1Q5VVQ6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
YOD1Q5VVQ6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
YOD1Q5VVQ6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
YOD1Q5VVQ6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
YOD1Q5VVQ6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
YOD1Q5VVQ6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
YOD1Q5VVQ6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
YOD1Q5VVQ6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
YOD1Q5VVQ6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
YOD1Q5VVQ6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
YOD1Q5VVQ6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
YOD1Q5VVQ6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
YOD1Q5VVQ6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
YOD1Q5VVQ6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
YOD1Q5VVQ6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
YOD1Q5VVQ6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
YOD1Q5VVQ6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 395.6 ms