Protein–RNA interactions for Protein: Q5TA31

RNF187, E3 ubiquitin-protein ligase RNF187, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF187Q5TA31 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF187Q5TA31 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF187Q5TA31 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF187Q5TA31 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF187Q5TA31 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF187Q5TA31 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF187Q5TA31 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF187Q5TA31 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF187Q5TA31 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF187Q5TA31 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF187Q5TA31 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF187Q5TA31 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF187Q5TA31 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF187Q5TA31 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF187Q5TA31 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF187Q5TA31 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF187Q5TA31 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF187Q5TA31 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF187Q5TA31 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF187Q5TA31 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF187Q5TA31 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF187Q5TA31 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF187Q5TA31 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF187Q5TA31 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF187Q5TA31 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF187Q5TA31 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF187Q5TA31 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF187Q5TA31 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF187Q5TA31 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF187Q5TA31 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF187Q5TA31 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF187Q5TA31 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF187Q5TA31 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF187Q5TA31 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF187Q5TA31 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF187Q5TA31 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF187Q5TA31 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF187Q5TA31 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF187Q5TA31 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF187Q5TA31 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF187Q5TA31 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF187Q5TA31 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF187Q5TA31 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF187Q5TA31 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF187Q5TA31 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF187Q5TA31 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF187Q5TA31 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF187Q5TA31 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF187Q5TA31 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF187Q5TA31 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF187Q5TA31 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF187Q5TA31 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF187Q5TA31 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF187Q5TA31 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF187Q5TA31 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF187Q5TA31 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF187Q5TA31 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF187Q5TA31 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF187Q5TA31 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF187Q5TA31 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF187Q5TA31 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF187Q5TA31 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF187Q5TA31 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF187Q5TA31 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF187Q5TA31 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF187Q5TA31 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF187Q5TA31 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF187Q5TA31 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF187Q5TA31 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF187Q5TA31 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF187Q5TA31 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF187Q5TA31 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF187Q5TA31 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF187Q5TA31 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF187Q5TA31 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF187Q5TA31 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF187Q5TA31 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF187Q5TA31 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF187Q5TA31 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF187Q5TA31 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF187Q5TA31 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF187Q5TA31 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF187Q5TA31 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF187Q5TA31 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF187Q5TA31 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF187Q5TA31 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF187Q5TA31 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF187Q5TA31 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF187Q5TA31 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF187Q5TA31 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF187Q5TA31 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF187Q5TA31 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF187Q5TA31 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF187Q5TA31 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF187Q5TA31 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF187Q5TA31 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF187Q5TA31 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF187Q5TA31 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF187Q5TA31 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF187Q5TA31 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms