Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4I8

C6orf52, Putative uncharacterized protein C6orf52, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf52Q5T4I8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C6orf52Q5T4I8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C6orf52Q5T4I8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C6orf52Q5T4I8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C6orf52Q5T4I8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C6orf52Q5T4I8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C6orf52Q5T4I8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C6orf52Q5T4I8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C6orf52Q5T4I8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C6orf52Q5T4I8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C6orf52Q5T4I8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C6orf52Q5T4I8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C6orf52Q5T4I8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C6orf52Q5T4I8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C6orf52Q5T4I8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C6orf52Q5T4I8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C6orf52Q5T4I8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C6orf52Q5T4I8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C6orf52Q5T4I8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C6orf52Q5T4I8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C6orf52Q5T4I8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C6orf52Q5T4I8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C6orf52Q5T4I8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C6orf52Q5T4I8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
C6orf52Q5T4I8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C6orf52Q5T4I8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C6orf52Q5T4I8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C6orf52Q5T4I8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C6orf52Q5T4I8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C6orf52Q5T4I8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C6orf52Q5T4I8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C6orf52Q5T4I8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C6orf52Q5T4I8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C6orf52Q5T4I8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C6orf52Q5T4I8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C6orf52Q5T4I8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C6orf52Q5T4I8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C6orf52Q5T4I8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C6orf52Q5T4I8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C6orf52Q5T4I8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C6orf52Q5T4I8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C6orf52Q5T4I8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
C6orf52Q5T4I8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
C6orf52Q5T4I8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
C6orf52Q5T4I8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
C6orf52Q5T4I8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C6orf52Q5T4I8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C6orf52Q5T4I8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C6orf52Q5T4I8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C6orf52Q5T4I8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C6orf52Q5T4I8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C6orf52Q5T4I8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C6orf52Q5T4I8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C6orf52Q5T4I8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C6orf52Q5T4I8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C6orf52Q5T4I8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C6orf52Q5T4I8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C6orf52Q5T4I8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C6orf52Q5T4I8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C6orf52Q5T4I8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C6orf52Q5T4I8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C6orf52Q5T4I8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C6orf52Q5T4I8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C6orf52Q5T4I8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C6orf52Q5T4I8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C6orf52Q5T4I8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C6orf52Q5T4I8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C6orf52Q5T4I8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C6orf52Q5T4I8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C6orf52Q5T4I8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C6orf52Q5T4I8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C6orf52Q5T4I8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
C6orf52Q5T4I8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C6orf52Q5T4I8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C6orf52Q5T4I8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C6orf52Q5T4I8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C6orf52Q5T4I8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C6orf52Q5T4I8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C6orf52Q5T4I8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C6orf52Q5T4I8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C6orf52Q5T4I8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C6orf52Q5T4I8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C6orf52Q5T4I8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C6orf52Q5T4I8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C6orf52Q5T4I8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C6orf52Q5T4I8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C6orf52Q5T4I8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C6orf52Q5T4I8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
C6orf52Q5T4I8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C6orf52Q5T4I8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C6orf52Q5T4I8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C6orf52Q5T4I8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C6orf52Q5T4I8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C6orf52Q5T4I8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C6orf52Q5T4I8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C6orf52Q5T4I8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C6orf52Q5T4I8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C6orf52Q5T4I8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C6orf52Q5T4I8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C6orf52Q5T4I8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms