Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2W1

PDZK1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF3, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1Q5T2W1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZK1Q5T2W1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZK1Q5T2W1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZK1Q5T2W1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZK1Q5T2W1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZK1Q5T2W1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZK1Q5T2W1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZK1Q5T2W1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZK1Q5T2W1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZK1Q5T2W1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZK1Q5T2W1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZK1Q5T2W1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZK1Q5T2W1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZK1Q5T2W1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZK1Q5T2W1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZK1Q5T2W1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZK1Q5T2W1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZK1Q5T2W1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZK1Q5T2W1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZK1Q5T2W1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZK1Q5T2W1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDZK1Q5T2W1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDZK1Q5T2W1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDZK1Q5T2W1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDZK1Q5T2W1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDZK1Q5T2W1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDZK1Q5T2W1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDZK1Q5T2W1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDZK1Q5T2W1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDZK1Q5T2W1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDZK1Q5T2W1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDZK1Q5T2W1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDZK1Q5T2W1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PDZK1Q5T2W1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDZK1Q5T2W1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDZK1Q5T2W1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDZK1Q5T2W1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PDZK1Q5T2W1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PDZK1Q5T2W1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDZK1Q5T2W1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDZK1Q5T2W1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDZK1Q5T2W1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDZK1Q5T2W1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDZK1Q5T2W1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDZK1Q5T2W1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDZK1Q5T2W1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDZK1Q5T2W1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDZK1Q5T2W1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDZK1Q5T2W1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDZK1Q5T2W1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PDZK1Q5T2W1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PDZK1Q5T2W1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PDZK1Q5T2W1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDZK1Q5T2W1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDZK1Q5T2W1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PDZK1Q5T2W1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDZK1Q5T2W1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDZK1Q5T2W1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDZK1Q5T2W1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDZK1Q5T2W1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDZK1Q5T2W1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDZK1Q5T2W1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDZK1Q5T2W1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDZK1Q5T2W1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDZK1Q5T2W1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDZK1Q5T2W1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDZK1Q5T2W1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDZK1Q5T2W1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDZK1Q5T2W1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDZK1Q5T2W1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDZK1Q5T2W1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDZK1Q5T2W1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDZK1Q5T2W1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDZK1Q5T2W1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDZK1Q5T2W1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDZK1Q5T2W1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDZK1Q5T2W1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDZK1Q5T2W1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDZK1Q5T2W1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDZK1Q5T2W1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDZK1Q5T2W1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDZK1Q5T2W1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDZK1Q5T2W1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDZK1Q5T2W1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDZK1Q5T2W1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDZK1Q5T2W1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDZK1Q5T2W1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDZK1Q5T2W1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDZK1Q5T2W1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDZK1Q5T2W1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDZK1Q5T2W1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDZK1Q5T2W1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDZK1Q5T2W1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDZK1Q5T2W1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDZK1Q5T2W1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDZK1Q5T2W1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDZK1Q5T2W1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDZK1Q5T2W1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDZK1Q5T2W1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDZK1Q5T2W1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms