Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
FRMPD1Q5SYB0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
FRMPD1Q5SYB0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
FRMPD1Q5SYB0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
FRMPD1Q5SYB0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
FRMPD1Q5SYB0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
FRMPD1Q5SYB0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
FRMPD1Q5SYB0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
FRMPD1Q5SYB0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
FRMPD1Q5SYB0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
FRMPD1Q5SYB0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
FRMPD1Q5SYB0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
FRMPD1Q5SYB0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
FRMPD1Q5SYB0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
FRMPD1Q5SYB0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
FRMPD1Q5SYB0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
FRMPD1Q5SYB0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
FRMPD1Q5SYB0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
FRMPD1Q5SYB0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
FRMPD1Q5SYB0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
FRMPD1Q5SYB0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
FRMPD1Q5SYB0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC36.37■■■■□ 3.41
FRMPD1Q5SYB0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
FRMPD1Q5SYB0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
FRMPD1Q5SYB0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
FRMPD1Q5SYB0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
FRMPD1Q5SYB0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
FRMPD1Q5SYB0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC36.36■■■■□ 3.41
FRMPD1Q5SYB0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
FRMPD1Q5SYB0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
FRMPD1Q5SYB0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
FRMPD1Q5SYB0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
FRMPD1Q5SYB0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
FRMPD1Q5SYB0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
FRMPD1Q5SYB0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
FRMPD1Q5SYB0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
FRMPD1Q5SYB0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
FRMPD1Q5SYB0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
FRMPD1Q5SYB0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
FRMPD1Q5SYB0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
FRMPD1Q5SYB0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.41
FRMPD1Q5SYB0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
FRMPD1Q5SYB0 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
FRMPD1Q5SYB0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
FRMPD1Q5SYB0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
FRMPD1Q5SYB0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
FRMPD1Q5SYB0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
FRMPD1Q5SYB0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
FRMPD1Q5SYB0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
FRMPD1Q5SYB0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
FRMPD1Q5SYB0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
FRMPD1Q5SYB0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
FRMPD1Q5SYB0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
FRMPD1Q5SYB0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
FRMPD1Q5SYB0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
FRMPD1Q5SYB0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
FRMPD1Q5SYB0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
FRMPD1Q5SYB0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
FRMPD1Q5SYB0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
FRMPD1Q5SYB0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
FRMPD1Q5SYB0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
FRMPD1Q5SYB0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
FRMPD1Q5SYB0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
FRMPD1Q5SYB0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
FRMPD1Q5SYB0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
FRMPD1Q5SYB0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
FRMPD1Q5SYB0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC36.26■■■■□ 3.39
FRMPD1Q5SYB0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
FRMPD1Q5SYB0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.26■■■■□ 3.39
FRMPD1Q5SYB0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.39
FRMPD1Q5SYB0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
FRMPD1Q5SYB0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
FRMPD1Q5SYB0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
FRMPD1Q5SYB0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
FRMPD1Q5SYB0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
FRMPD1Q5SYB0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
FRMPD1Q5SYB0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
FRMPD1Q5SYB0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
FRMPD1Q5SYB0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
FRMPD1Q5SYB0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
FRMPD1Q5SYB0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC36.23■■■■□ 3.39
FRMPD1Q5SYB0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
FRMPD1Q5SYB0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
FRMPD1Q5SYB0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
FRMPD1Q5SYB0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
FRMPD1Q5SYB0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC36.23■■■■□ 3.39
FRMPD1Q5SYB0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
FRMPD1Q5SYB0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
FRMPD1Q5SYB0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
FRMPD1Q5SYB0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
FRMPD1Q5SYB0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
FRMPD1Q5SYB0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
FRMPD1Q5SYB0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
FRMPD1Q5SYB0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
FRMPD1Q5SYB0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
FRMPD1Q5SYB0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
FRMPD1Q5SYB0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
FRMPD1Q5SYB0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
FRMPD1Q5SYB0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
FRMPD1Q5SYB0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms