Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PERM1Q5SV97 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PERM1Q5SV97 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PERM1Q5SV97 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PERM1Q5SV97 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PERM1Q5SV97 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PERM1Q5SV97 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PERM1Q5SV97 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PERM1Q5SV97 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PERM1Q5SV97 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PERM1Q5SV97 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PERM1Q5SV97 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PERM1Q5SV97 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PERM1Q5SV97 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PERM1Q5SV97 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PERM1Q5SV97 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PERM1Q5SV97 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PERM1Q5SV97 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PERM1Q5SV97 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PERM1Q5SV97 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PERM1Q5SV97 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PERM1Q5SV97 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PERM1Q5SV97 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PERM1Q5SV97 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PERM1Q5SV97 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PERM1Q5SV97 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PERM1Q5SV97 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PERM1Q5SV97 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PERM1Q5SV97 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PERM1Q5SV97 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PERM1Q5SV97 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PERM1Q5SV97 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PERM1Q5SV97 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PERM1Q5SV97 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PERM1Q5SV97 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PERM1Q5SV97 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PERM1Q5SV97 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PERM1Q5SV97 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PERM1Q5SV97 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PERM1Q5SV97 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PERM1Q5SV97 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PERM1Q5SV97 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PERM1Q5SV97 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PERM1Q5SV97 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PERM1Q5SV97 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PERM1Q5SV97 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PERM1Q5SV97 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PERM1Q5SV97 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PERM1Q5SV97 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PERM1Q5SV97 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PERM1Q5SV97 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PERM1Q5SV97 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PERM1Q5SV97 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PERM1Q5SV97 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PERM1Q5SV97 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PERM1Q5SV97 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PERM1Q5SV97 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PERM1Q5SV97 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PERM1Q5SV97 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PERM1Q5SV97 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PERM1Q5SV97 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PERM1Q5SV97 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PERM1Q5SV97 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PERM1Q5SV97 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PERM1Q5SV97 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PERM1Q5SV97 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PERM1Q5SV97 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PERM1Q5SV97 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PERM1Q5SV97 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PERM1Q5SV97 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PERM1Q5SV97 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PERM1Q5SV97 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PERM1Q5SV97 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PERM1Q5SV97 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PERM1Q5SV97 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PERM1Q5SV97 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PERM1Q5SV97 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PERM1Q5SV97 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PERM1Q5SV97 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PERM1Q5SV97 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PERM1Q5SV97 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PERM1Q5SV97 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PERM1Q5SV97 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PERM1Q5SV97 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PERM1Q5SV97 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PERM1Q5SV97 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PERM1Q5SV97 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PERM1Q5SV97 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PERM1Q5SV97 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PERM1Q5SV97 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PERM1Q5SV97 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PERM1Q5SV97 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PERM1Q5SV97 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PERM1Q5SV97 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PERM1Q5SV97 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PERM1Q5SV97 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PERM1Q5SV97 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PERM1Q5SV97 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PERM1Q5SV97 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PERM1Q5SV97 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms