Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQQ9

VAX1, Ventral anterior homeobox 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX1Q5SQQ9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
VAX1Q5SQQ9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VAX1Q5SQQ9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VAX1Q5SQQ9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VAX1Q5SQQ9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VAX1Q5SQQ9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
VAX1Q5SQQ9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VAX1Q5SQQ9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VAX1Q5SQQ9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VAX1Q5SQQ9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
VAX1Q5SQQ9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VAX1Q5SQQ9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VAX1Q5SQQ9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VAX1Q5SQQ9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VAX1Q5SQQ9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VAX1Q5SQQ9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VAX1Q5SQQ9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VAX1Q5SQQ9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VAX1Q5SQQ9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VAX1Q5SQQ9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VAX1Q5SQQ9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VAX1Q5SQQ9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VAX1Q5SQQ9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VAX1Q5SQQ9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VAX1Q5SQQ9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
VAX1Q5SQQ9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VAX1Q5SQQ9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VAX1Q5SQQ9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VAX1Q5SQQ9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VAX1Q5SQQ9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VAX1Q5SQQ9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VAX1Q5SQQ9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VAX1Q5SQQ9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VAX1Q5SQQ9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VAX1Q5SQQ9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VAX1Q5SQQ9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VAX1Q5SQQ9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VAX1Q5SQQ9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VAX1Q5SQQ9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VAX1Q5SQQ9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VAX1Q5SQQ9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
VAX1Q5SQQ9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VAX1Q5SQQ9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VAX1Q5SQQ9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VAX1Q5SQQ9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VAX1Q5SQQ9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VAX1Q5SQQ9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VAX1Q5SQQ9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VAX1Q5SQQ9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VAX1Q5SQQ9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VAX1Q5SQQ9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VAX1Q5SQQ9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VAX1Q5SQQ9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VAX1Q5SQQ9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
VAX1Q5SQQ9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
VAX1Q5SQQ9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
VAX1Q5SQQ9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VAX1Q5SQQ9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VAX1Q5SQQ9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VAX1Q5SQQ9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
VAX1Q5SQQ9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VAX1Q5SQQ9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VAX1Q5SQQ9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
VAX1Q5SQQ9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VAX1Q5SQQ9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VAX1Q5SQQ9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VAX1Q5SQQ9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VAX1Q5SQQ9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VAX1Q5SQQ9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VAX1Q5SQQ9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
VAX1Q5SQQ9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
VAX1Q5SQQ9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
VAX1Q5SQQ9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VAX1Q5SQQ9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VAX1Q5SQQ9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VAX1Q5SQQ9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VAX1Q5SQQ9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VAX1Q5SQQ9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VAX1Q5SQQ9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VAX1Q5SQQ9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VAX1Q5SQQ9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VAX1Q5SQQ9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VAX1Q5SQQ9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VAX1Q5SQQ9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VAX1Q5SQQ9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VAX1Q5SQQ9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VAX1Q5SQQ9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VAX1Q5SQQ9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VAX1Q5SQQ9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VAX1Q5SQQ9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VAX1Q5SQQ9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VAX1Q5SQQ9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VAX1Q5SQQ9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VAX1Q5SQQ9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VAX1Q5SQQ9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
VAX1Q5SQQ9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VAX1Q5SQQ9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VAX1Q5SQQ9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VAX1Q5SQQ9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
VAX1Q5SQQ9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms