Protein–RNA interactions for Protein: Q5JV73

FRMPD3, FERM and PDZ domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD3Q5JV73 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
FRMPD3Q5JV73 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
FRMPD3Q5JV73 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FRMPD3Q5JV73 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FRMPD3Q5JV73 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FRMPD3Q5JV73 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FRMPD3Q5JV73 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FRMPD3Q5JV73 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
FRMPD3Q5JV73 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FRMPD3Q5JV73 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FRMPD3Q5JV73 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FRMPD3Q5JV73 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FRMPD3Q5JV73 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FRMPD3Q5JV73 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FRMPD3Q5JV73 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FRMPD3Q5JV73 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FRMPD3Q5JV73 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
FRMPD3Q5JV73 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FRMPD3Q5JV73 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FRMPD3Q5JV73 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
FRMPD3Q5JV73 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
FRMPD3Q5JV73 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
FRMPD3Q5JV73 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FRMPD3Q5JV73 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FRMPD3Q5JV73 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FRMPD3Q5JV73 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FRMPD3Q5JV73 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
FRMPD3Q5JV73 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
FRMPD3Q5JV73 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FRMPD3Q5JV73 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FRMPD3Q5JV73 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FRMPD3Q5JV73 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FRMPD3Q5JV73 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FRMPD3Q5JV73 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FRMPD3Q5JV73 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FRMPD3Q5JV73 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FRMPD3Q5JV73 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FRMPD3Q5JV73 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FRMPD3Q5JV73 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FRMPD3Q5JV73 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FRMPD3Q5JV73 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FRMPD3Q5JV73 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FRMPD3Q5JV73 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FRMPD3Q5JV73 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
FRMPD3Q5JV73 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FRMPD3Q5JV73 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FRMPD3Q5JV73 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FRMPD3Q5JV73 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
FRMPD3Q5JV73 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
FRMPD3Q5JV73 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FRMPD3Q5JV73 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FRMPD3Q5JV73 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FRMPD3Q5JV73 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
FRMPD3Q5JV73 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FRMPD3Q5JV73 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FRMPD3Q5JV73 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FRMPD3Q5JV73 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FRMPD3Q5JV73 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FRMPD3Q5JV73 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FRMPD3Q5JV73 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
FRMPD3Q5JV73 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
FRMPD3Q5JV73 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
FRMPD3Q5JV73 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
FRMPD3Q5JV73 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
FRMPD3Q5JV73 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FRMPD3Q5JV73 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FRMPD3Q5JV73 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FRMPD3Q5JV73 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FRMPD3Q5JV73 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FRMPD3Q5JV73 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
FRMPD3Q5JV73 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FRMPD3Q5JV73 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FRMPD3Q5JV73 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FRMPD3Q5JV73 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FRMPD3Q5JV73 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FRMPD3Q5JV73 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FRMPD3Q5JV73 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FRMPD3Q5JV73 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FRMPD3Q5JV73 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FRMPD3Q5JV73 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FRMPD3Q5JV73 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FRMPD3Q5JV73 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FRMPD3Q5JV73 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FRMPD3Q5JV73 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FRMPD3Q5JV73 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FRMPD3Q5JV73 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FRMPD3Q5JV73 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FRMPD3Q5JV73 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
FRMPD3Q5JV73 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FRMPD3Q5JV73 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FRMPD3Q5JV73 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FRMPD3Q5JV73 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FRMPD3Q5JV73 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FRMPD3Q5JV73 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FRMPD3Q5JV73 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FRMPD3Q5JV73 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
FRMPD3Q5JV73 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FRMPD3Q5JV73 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FRMPD3Q5JV73 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.85
FRMPD3Q5JV73 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms