Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH77

XKR3, XK-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR3Q5GH77 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
XKR3Q5GH77 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
XKR3Q5GH77 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
XKR3Q5GH77 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
XKR3Q5GH77 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
XKR3Q5GH77 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
XKR3Q5GH77 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
XKR3Q5GH77 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
XKR3Q5GH77 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
XKR3Q5GH77 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
XKR3Q5GH77 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
XKR3Q5GH77 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
XKR3Q5GH77 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
XKR3Q5GH77 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
XKR3Q5GH77 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
XKR3Q5GH77 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
XKR3Q5GH77 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
XKR3Q5GH77 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
XKR3Q5GH77 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
XKR3Q5GH77 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
XKR3Q5GH77 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
XKR3Q5GH77 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
XKR3Q5GH77 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
XKR3Q5GH77 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
XKR3Q5GH77 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
XKR3Q5GH77 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
XKR3Q5GH77 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
XKR3Q5GH77 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
XKR3Q5GH77 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
XKR3Q5GH77 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
XKR3Q5GH77 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
XKR3Q5GH77 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
XKR3Q5GH77 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
XKR3Q5GH77 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
XKR3Q5GH77 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
XKR3Q5GH77 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
XKR3Q5GH77 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
XKR3Q5GH77 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
XKR3Q5GH77 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
XKR3Q5GH77 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
XKR3Q5GH77 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
XKR3Q5GH77 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
XKR3Q5GH77 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
XKR3Q5GH77 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
XKR3Q5GH77 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
XKR3Q5GH77 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
XKR3Q5GH77 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
XKR3Q5GH77 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
XKR3Q5GH77 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
XKR3Q5GH77 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
XKR3Q5GH77 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
XKR3Q5GH77 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
XKR3Q5GH77 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
XKR3Q5GH77 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
XKR3Q5GH77 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
XKR3Q5GH77 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
XKR3Q5GH77 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
XKR3Q5GH77 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
XKR3Q5GH77 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
XKR3Q5GH77 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
XKR3Q5GH77 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
XKR3Q5GH77 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
XKR3Q5GH77 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
XKR3Q5GH77 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
XKR3Q5GH77 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
XKR3Q5GH77 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
XKR3Q5GH77 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
XKR3Q5GH77 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
XKR3Q5GH77 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
XKR3Q5GH77 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
XKR3Q5GH77 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
XKR3Q5GH77 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
XKR3Q5GH77 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
XKR3Q5GH77 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
XKR3Q5GH77 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
XKR3Q5GH77 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
XKR3Q5GH77 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
XKR3Q5GH77 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
XKR3Q5GH77 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
XKR3Q5GH77 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
XKR3Q5GH77 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
XKR3Q5GH77 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
XKR3Q5GH77 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
XKR3Q5GH77 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
XKR3Q5GH77 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
XKR3Q5GH77 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
XKR3Q5GH77 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
XKR3Q5GH77 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
XKR3Q5GH77 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
XKR3Q5GH77 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
XKR3Q5GH77 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
XKR3Q5GH77 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
XKR3Q5GH77 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
XKR3Q5GH77 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
XKR3Q5GH77 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
XKR3Q5GH77 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
XKR3Q5GH77 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
XKR3Q5GH77 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
XKR3Q5GH77 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
XKR3Q5GH77 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms