Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBM4

ZNF542P, Putative zinc finger protein 542, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF542PQ5EBM4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF542PQ5EBM4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF542PQ5EBM4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF542PQ5EBM4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF542PQ5EBM4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF542PQ5EBM4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF542PQ5EBM4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF542PQ5EBM4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF542PQ5EBM4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF542PQ5EBM4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF542PQ5EBM4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF542PQ5EBM4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF542PQ5EBM4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF542PQ5EBM4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF542PQ5EBM4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF542PQ5EBM4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF542PQ5EBM4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF542PQ5EBM4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF542PQ5EBM4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF542PQ5EBM4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF542PQ5EBM4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF542PQ5EBM4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF542PQ5EBM4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF542PQ5EBM4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF542PQ5EBM4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF542PQ5EBM4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF542PQ5EBM4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF542PQ5EBM4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF542PQ5EBM4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF542PQ5EBM4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF542PQ5EBM4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF542PQ5EBM4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF542PQ5EBM4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF542PQ5EBM4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF542PQ5EBM4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF542PQ5EBM4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF542PQ5EBM4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF542PQ5EBM4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF542PQ5EBM4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF542PQ5EBM4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF542PQ5EBM4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF542PQ5EBM4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF542PQ5EBM4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF542PQ5EBM4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF542PQ5EBM4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF542PQ5EBM4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF542PQ5EBM4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF542PQ5EBM4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF542PQ5EBM4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF542PQ5EBM4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF542PQ5EBM4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF542PQ5EBM4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF542PQ5EBM4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF542PQ5EBM4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF542PQ5EBM4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF542PQ5EBM4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF542PQ5EBM4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF542PQ5EBM4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF542PQ5EBM4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF542PQ5EBM4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF542PQ5EBM4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF542PQ5EBM4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF542PQ5EBM4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF542PQ5EBM4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF542PQ5EBM4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF542PQ5EBM4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF542PQ5EBM4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF542PQ5EBM4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF542PQ5EBM4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF542PQ5EBM4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF542PQ5EBM4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF542PQ5EBM4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF542PQ5EBM4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF542PQ5EBM4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF542PQ5EBM4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF542PQ5EBM4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF542PQ5EBM4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF542PQ5EBM4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF542PQ5EBM4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF542PQ5EBM4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNF542PQ5EBM4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF542PQ5EBM4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF542PQ5EBM4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF542PQ5EBM4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF542PQ5EBM4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF542PQ5EBM4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF542PQ5EBM4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF542PQ5EBM4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF542PQ5EBM4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF542PQ5EBM4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF542PQ5EBM4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF542PQ5EBM4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF542PQ5EBM4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF542PQ5EBM4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF542PQ5EBM4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF542PQ5EBM4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF542PQ5EBM4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF542PQ5EBM4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF542PQ5EBM4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF542PQ5EBM4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms