Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALFQ53S48 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALFQ53S48 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALFQ53S48 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALFQ53S48 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALFQ53S48 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALFQ53S48 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALFQ53S48 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALFQ53S48 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALFQ53S48 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALFQ53S48 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALFQ53S48 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALFQ53S48 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALFQ53S48 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALFQ53S48 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALFQ53S48 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALFQ53S48 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALFQ53S48 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALFQ53S48 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALFQ53S48 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALFQ53S48 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALFQ53S48 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALFQ53S48 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALFQ53S48 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ALFQ53S48 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALFQ53S48 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALFQ53S48 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ALFQ53S48 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ALFQ53S48 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ALFQ53S48 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ALFQ53S48 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALFQ53S48 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ALFQ53S48 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALFQ53S48 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALFQ53S48 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALFQ53S48 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ALFQ53S48 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALFQ53S48 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALFQ53S48 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALFQ53S48 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALFQ53S48 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALFQ53S48 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALFQ53S48 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALFQ53S48 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALFQ53S48 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALFQ53S48 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALFQ53S48 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALFQ53S48 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALFQ53S48 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALFQ53S48 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALFQ53S48 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALFQ53S48 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALFQ53S48 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALFQ53S48 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALFQ53S48 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALFQ53S48 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALFQ53S48 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALFQ53S48 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALFQ53S48 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALFQ53S48 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALFQ53S48 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALFQ53S48 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALFQ53S48 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALFQ53S48 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALFQ53S48 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALFQ53S48 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ALFQ53S48 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ALFQ53S48 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ALFQ53S48 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALFQ53S48 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALFQ53S48 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALFQ53S48 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALFQ53S48 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALFQ53S48 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALFQ53S48 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALFQ53S48 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALFQ53S48 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALFQ53S48 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ALFQ53S48 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALFQ53S48 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALFQ53S48 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALFQ53S48 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALFQ53S48 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ALFQ53S48 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ALFQ53S48 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ALFQ53S48 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ALFQ53S48 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ALFQ53S48 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ALFQ53S48 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ALFQ53S48 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ALFQ53S48 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALFQ53S48 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALFQ53S48 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALFQ53S48 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALFQ53S48 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALFQ53S48 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALFQ53S48 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ALFQ53S48 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALFQ53S48 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALFQ53S48 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms