Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL22Q53GT1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL22Q53GT1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL22Q53GT1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL22Q53GT1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL22Q53GT1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL22Q53GT1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL22Q53GT1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL22Q53GT1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL22Q53GT1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL22Q53GT1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL22Q53GT1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL22Q53GT1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL22Q53GT1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL22Q53GT1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL22Q53GT1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL22Q53GT1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL22Q53GT1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL22Q53GT1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL22Q53GT1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL22Q53GT1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL22Q53GT1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL22Q53GT1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL22Q53GT1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL22Q53GT1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL22Q53GT1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL22Q53GT1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL22Q53GT1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL22Q53GT1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL22Q53GT1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL22Q53GT1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL22Q53GT1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL22Q53GT1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL22Q53GT1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL22Q53GT1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL22Q53GT1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL22Q53GT1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL22Q53GT1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL22Q53GT1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL22Q53GT1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL22Q53GT1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL22Q53GT1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL22Q53GT1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL22Q53GT1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL22Q53GT1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL22Q53GT1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL22Q53GT1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL22Q53GT1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL22Q53GT1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL22Q53GT1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL22Q53GT1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL22Q53GT1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL22Q53GT1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL22Q53GT1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL22Q53GT1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL22Q53GT1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL22Q53GT1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL22Q53GT1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL22Q53GT1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL22Q53GT1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL22Q53GT1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL22Q53GT1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL22Q53GT1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL22Q53GT1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL22Q53GT1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL22Q53GT1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL22Q53GT1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL22Q53GT1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL22Q53GT1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL22Q53GT1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL22Q53GT1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL22Q53GT1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL22Q53GT1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL22Q53GT1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL22Q53GT1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL22Q53GT1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL22Q53GT1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL22Q53GT1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL22Q53GT1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL22Q53GT1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL22Q53GT1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL22Q53GT1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL22Q53GT1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL22Q53GT1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL22Q53GT1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL22Q53GT1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL22Q53GT1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL22Q53GT1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL22Q53GT1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL22Q53GT1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL22Q53GT1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL22Q53GT1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL22Q53GT1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL22Q53GT1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL22Q53GT1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
KLHL22Q53GT1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
KLHL22Q53GT1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL22Q53GT1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL22Q53GT1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL22Q53GT1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1653.4 ms