Protein–RNA interactions for Protein: Q53GI3

ZNF394, Zinc finger protein 394, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF394Q53GI3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF394Q53GI3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF394Q53GI3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF394Q53GI3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF394Q53GI3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF394Q53GI3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF394Q53GI3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF394Q53GI3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF394Q53GI3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF394Q53GI3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF394Q53GI3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF394Q53GI3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF394Q53GI3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF394Q53GI3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF394Q53GI3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF394Q53GI3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
ZNF394Q53GI3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZNF394Q53GI3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF394Q53GI3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF394Q53GI3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF394Q53GI3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF394Q53GI3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF394Q53GI3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF394Q53GI3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF394Q53GI3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF394Q53GI3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF394Q53GI3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF394Q53GI3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF394Q53GI3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF394Q53GI3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF394Q53GI3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF394Q53GI3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF394Q53GI3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF394Q53GI3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF394Q53GI3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF394Q53GI3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF394Q53GI3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF394Q53GI3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF394Q53GI3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF394Q53GI3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF394Q53GI3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF394Q53GI3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF394Q53GI3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF394Q53GI3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF394Q53GI3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF394Q53GI3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF394Q53GI3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF394Q53GI3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF394Q53GI3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF394Q53GI3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF394Q53GI3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF394Q53GI3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF394Q53GI3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF394Q53GI3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF394Q53GI3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF394Q53GI3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF394Q53GI3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF394Q53GI3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF394Q53GI3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF394Q53GI3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF394Q53GI3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF394Q53GI3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF394Q53GI3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF394Q53GI3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF394Q53GI3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF394Q53GI3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF394Q53GI3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF394Q53GI3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF394Q53GI3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF394Q53GI3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF394Q53GI3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF394Q53GI3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF394Q53GI3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF394Q53GI3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF394Q53GI3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF394Q53GI3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF394Q53GI3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF394Q53GI3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF394Q53GI3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF394Q53GI3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF394Q53GI3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF394Q53GI3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF394Q53GI3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF394Q53GI3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF394Q53GI3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF394Q53GI3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF394Q53GI3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF394Q53GI3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF394Q53GI3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF394Q53GI3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF394Q53GI3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF394Q53GI3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF394Q53GI3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF394Q53GI3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF394Q53GI3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF394Q53GI3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF394Q53GI3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF394Q53GI3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF394Q53GI3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF394Q53GI3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms