Protein–RNA interactions for Protein: Q53EZ4

CEP55, Centrosomal protein of 55 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP55Q53EZ4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CEP55Q53EZ4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CEP55Q53EZ4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CEP55Q53EZ4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CEP55Q53EZ4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CEP55Q53EZ4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CEP55Q53EZ4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CEP55Q53EZ4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CEP55Q53EZ4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CEP55Q53EZ4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CEP55Q53EZ4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CEP55Q53EZ4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CEP55Q53EZ4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CEP55Q53EZ4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CEP55Q53EZ4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CEP55Q53EZ4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CEP55Q53EZ4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CEP55Q53EZ4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CEP55Q53EZ4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CEP55Q53EZ4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CEP55Q53EZ4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CEP55Q53EZ4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CEP55Q53EZ4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CEP55Q53EZ4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CEP55Q53EZ4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CEP55Q53EZ4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CEP55Q53EZ4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CEP55Q53EZ4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CEP55Q53EZ4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CEP55Q53EZ4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CEP55Q53EZ4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CEP55Q53EZ4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CEP55Q53EZ4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CEP55Q53EZ4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CEP55Q53EZ4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CEP55Q53EZ4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CEP55Q53EZ4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CEP55Q53EZ4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
CEP55Q53EZ4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CEP55Q53EZ4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CEP55Q53EZ4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CEP55Q53EZ4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CEP55Q53EZ4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CEP55Q53EZ4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CEP55Q53EZ4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CEP55Q53EZ4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CEP55Q53EZ4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CEP55Q53EZ4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CEP55Q53EZ4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CEP55Q53EZ4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CEP55Q53EZ4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CEP55Q53EZ4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CEP55Q53EZ4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CEP55Q53EZ4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CEP55Q53EZ4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CEP55Q53EZ4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CEP55Q53EZ4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CEP55Q53EZ4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CEP55Q53EZ4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CEP55Q53EZ4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CEP55Q53EZ4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CEP55Q53EZ4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CEP55Q53EZ4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CEP55Q53EZ4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CEP55Q53EZ4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CEP55Q53EZ4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CEP55Q53EZ4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CEP55Q53EZ4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CEP55Q53EZ4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CEP55Q53EZ4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CEP55Q53EZ4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CEP55Q53EZ4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CEP55Q53EZ4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CEP55Q53EZ4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CEP55Q53EZ4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CEP55Q53EZ4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CEP55Q53EZ4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CEP55Q53EZ4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CEP55Q53EZ4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CEP55Q53EZ4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CEP55Q53EZ4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CEP55Q53EZ4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CEP55Q53EZ4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CEP55Q53EZ4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CEP55Q53EZ4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CEP55Q53EZ4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CEP55Q53EZ4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CEP55Q53EZ4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CEP55Q53EZ4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CEP55Q53EZ4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CEP55Q53EZ4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CEP55Q53EZ4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CEP55Q53EZ4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CEP55Q53EZ4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CEP55Q53EZ4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CEP55Q53EZ4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CEP55Q53EZ4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CEP55Q53EZ4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CEP55Q53EZ4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CEP55Q53EZ4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms