Protein–RNA interactions for Protein: Q495N2

SLC36A3, Proton-coupled amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC36A3Q495N2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC36A3Q495N2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC36A3Q495N2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC36A3Q495N2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC36A3Q495N2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC36A3Q495N2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC36A3Q495N2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC36A3Q495N2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC36A3Q495N2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC36A3Q495N2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC36A3Q495N2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC36A3Q495N2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC36A3Q495N2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC36A3Q495N2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC36A3Q495N2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC36A3Q495N2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC36A3Q495N2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC36A3Q495N2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC36A3Q495N2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC36A3Q495N2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC36A3Q495N2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC36A3Q495N2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC36A3Q495N2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC36A3Q495N2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC36A3Q495N2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC36A3Q495N2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC36A3Q495N2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC36A3Q495N2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC36A3Q495N2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC36A3Q495N2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC36A3Q495N2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC36A3Q495N2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC36A3Q495N2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC36A3Q495N2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC36A3Q495N2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC36A3Q495N2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC36A3Q495N2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC36A3Q495N2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC36A3Q495N2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC36A3Q495N2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC36A3Q495N2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC36A3Q495N2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC36A3Q495N2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC36A3Q495N2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC36A3Q495N2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC36A3Q495N2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC36A3Q495N2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC36A3Q495N2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC36A3Q495N2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC36A3Q495N2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC36A3Q495N2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC36A3Q495N2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC36A3Q495N2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC36A3Q495N2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC36A3Q495N2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC36A3Q495N2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC36A3Q495N2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC36A3Q495N2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC36A3Q495N2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC36A3Q495N2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC36A3Q495N2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC36A3Q495N2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC36A3Q495N2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC36A3Q495N2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC36A3Q495N2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC36A3Q495N2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC36A3Q495N2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC36A3Q495N2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC36A3Q495N2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC36A3Q495N2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC36A3Q495N2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC36A3Q495N2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC36A3Q495N2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC36A3Q495N2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC36A3Q495N2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC36A3Q495N2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC36A3Q495N2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC36A3Q495N2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC36A3Q495N2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC36A3Q495N2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC36A3Q495N2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC36A3Q495N2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC36A3Q495N2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC36A3Q495N2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC36A3Q495N2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC36A3Q495N2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC36A3Q495N2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC36A3Q495N2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC36A3Q495N2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC36A3Q495N2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC36A3Q495N2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC36A3Q495N2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC36A3Q495N2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC36A3Q495N2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC36A3Q495N2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC36A3Q495N2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC36A3Q495N2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC36A3Q495N2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC36A3Q495N2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC36A3Q495N2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms