Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BBS9Q3SYG4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BBS9Q3SYG4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BBS9Q3SYG4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BBS9Q3SYG4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BBS9Q3SYG4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BBS9Q3SYG4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BBS9Q3SYG4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BBS9Q3SYG4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BBS9Q3SYG4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BBS9Q3SYG4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BBS9Q3SYG4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BBS9Q3SYG4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BBS9Q3SYG4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BBS9Q3SYG4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BBS9Q3SYG4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BBS9Q3SYG4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BBS9Q3SYG4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BBS9Q3SYG4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BBS9Q3SYG4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BBS9Q3SYG4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BBS9Q3SYG4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BBS9Q3SYG4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
BBS9Q3SYG4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BBS9Q3SYG4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BBS9Q3SYG4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BBS9Q3SYG4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BBS9Q3SYG4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BBS9Q3SYG4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BBS9Q3SYG4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BBS9Q3SYG4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BBS9Q3SYG4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BBS9Q3SYG4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BBS9Q3SYG4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BBS9Q3SYG4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BBS9Q3SYG4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BBS9Q3SYG4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BBS9Q3SYG4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BBS9Q3SYG4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BBS9Q3SYG4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BBS9Q3SYG4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BBS9Q3SYG4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BBS9Q3SYG4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BBS9Q3SYG4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BBS9Q3SYG4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BBS9Q3SYG4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BBS9Q3SYG4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BBS9Q3SYG4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BBS9Q3SYG4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BBS9Q3SYG4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BBS9Q3SYG4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BBS9Q3SYG4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BBS9Q3SYG4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BBS9Q3SYG4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BBS9Q3SYG4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BBS9Q3SYG4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BBS9Q3SYG4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BBS9Q3SYG4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BBS9Q3SYG4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BBS9Q3SYG4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BBS9Q3SYG4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BBS9Q3SYG4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BBS9Q3SYG4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BBS9Q3SYG4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BBS9Q3SYG4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BBS9Q3SYG4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BBS9Q3SYG4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BBS9Q3SYG4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BBS9Q3SYG4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BBS9Q3SYG4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BBS9Q3SYG4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BBS9Q3SYG4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BBS9Q3SYG4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BBS9Q3SYG4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BBS9Q3SYG4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BBS9Q3SYG4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BBS9Q3SYG4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BBS9Q3SYG4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BBS9Q3SYG4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BBS9Q3SYG4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BBS9Q3SYG4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BBS9Q3SYG4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BBS9Q3SYG4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
BBS9Q3SYG4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BBS9Q3SYG4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BBS9Q3SYG4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BBS9Q3SYG4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BBS9Q3SYG4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BBS9Q3SYG4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BBS9Q3SYG4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BBS9Q3SYG4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BBS9Q3SYG4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BBS9Q3SYG4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BBS9Q3SYG4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BBS9Q3SYG4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BBS9Q3SYG4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BBS9Q3SYG4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BBS9Q3SYG4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BBS9Q3SYG4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BBS9Q3SYG4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms