Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXY7

LRIT3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT3Q3SXY7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LRIT3Q3SXY7 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRIT3Q3SXY7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRIT3Q3SXY7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
LRIT3Q3SXY7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRIT3Q3SXY7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRIT3Q3SXY7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRIT3Q3SXY7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRIT3Q3SXY7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRIT3Q3SXY7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRIT3Q3SXY7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRIT3Q3SXY7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRIT3Q3SXY7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRIT3Q3SXY7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRIT3Q3SXY7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRIT3Q3SXY7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRIT3Q3SXY7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRIT3Q3SXY7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRIT3Q3SXY7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRIT3Q3SXY7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRIT3Q3SXY7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRIT3Q3SXY7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRIT3Q3SXY7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRIT3Q3SXY7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRIT3Q3SXY7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
LRIT3Q3SXY7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRIT3Q3SXY7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRIT3Q3SXY7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRIT3Q3SXY7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRIT3Q3SXY7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRIT3Q3SXY7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRIT3Q3SXY7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRIT3Q3SXY7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRIT3Q3SXY7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
LRIT3Q3SXY7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRIT3Q3SXY7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRIT3Q3SXY7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRIT3Q3SXY7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRIT3Q3SXY7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
LRIT3Q3SXY7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LRIT3Q3SXY7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRIT3Q3SXY7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRIT3Q3SXY7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRIT3Q3SXY7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRIT3Q3SXY7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRIT3Q3SXY7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
LRIT3Q3SXY7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRIT3Q3SXY7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRIT3Q3SXY7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRIT3Q3SXY7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRIT3Q3SXY7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRIT3Q3SXY7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRIT3Q3SXY7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRIT3Q3SXY7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRIT3Q3SXY7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
LRIT3Q3SXY7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRIT3Q3SXY7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRIT3Q3SXY7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRIT3Q3SXY7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRIT3Q3SXY7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRIT3Q3SXY7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRIT3Q3SXY7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRIT3Q3SXY7 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRIT3Q3SXY7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRIT3Q3SXY7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRIT3Q3SXY7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRIT3Q3SXY7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRIT3Q3SXY7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRIT3Q3SXY7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRIT3Q3SXY7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRIT3Q3SXY7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRIT3Q3SXY7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRIT3Q3SXY7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRIT3Q3SXY7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRIT3Q3SXY7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRIT3Q3SXY7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRIT3Q3SXY7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRIT3Q3SXY7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRIT3Q3SXY7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRIT3Q3SXY7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRIT3Q3SXY7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
LRIT3Q3SXY7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRIT3Q3SXY7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRIT3Q3SXY7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
LRIT3Q3SXY7 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRIT3Q3SXY7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRIT3Q3SXY7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRIT3Q3SXY7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRIT3Q3SXY7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRIT3Q3SXY7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
LRIT3Q3SXY7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
LRIT3Q3SXY7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRIT3Q3SXY7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRIT3Q3SXY7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRIT3Q3SXY7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRIT3Q3SXY7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRIT3Q3SXY7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRIT3Q3SXY7 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
LRIT3Q3SXY7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRIT3Q3SXY7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms