Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKX8

ERCC6L, DNA excision repair protein ERCC-6-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6LQ2NKX8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERCC6LQ2NKX8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERCC6LQ2NKX8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERCC6LQ2NKX8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERCC6LQ2NKX8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERCC6LQ2NKX8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ERCC6LQ2NKX8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERCC6LQ2NKX8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ERCC6LQ2NKX8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERCC6LQ2NKX8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERCC6LQ2NKX8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERCC6LQ2NKX8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERCC6LQ2NKX8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERCC6LQ2NKX8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERCC6LQ2NKX8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERCC6LQ2NKX8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERCC6LQ2NKX8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERCC6LQ2NKX8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERCC6LQ2NKX8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERCC6LQ2NKX8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERCC6LQ2NKX8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERCC6LQ2NKX8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERCC6LQ2NKX8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERCC6LQ2NKX8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ERCC6LQ2NKX8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ERCC6LQ2NKX8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ERCC6LQ2NKX8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERCC6LQ2NKX8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ERCC6LQ2NKX8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERCC6LQ2NKX8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERCC6LQ2NKX8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERCC6LQ2NKX8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERCC6LQ2NKX8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERCC6LQ2NKX8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERCC6LQ2NKX8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERCC6LQ2NKX8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERCC6LQ2NKX8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERCC6LQ2NKX8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERCC6LQ2NKX8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERCC6LQ2NKX8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERCC6LQ2NKX8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERCC6LQ2NKX8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERCC6LQ2NKX8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERCC6LQ2NKX8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERCC6LQ2NKX8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERCC6LQ2NKX8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERCC6LQ2NKX8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERCC6LQ2NKX8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERCC6LQ2NKX8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERCC6LQ2NKX8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ERCC6LQ2NKX8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERCC6LQ2NKX8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERCC6LQ2NKX8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERCC6LQ2NKX8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERCC6LQ2NKX8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERCC6LQ2NKX8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERCC6LQ2NKX8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERCC6LQ2NKX8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ERCC6LQ2NKX8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERCC6LQ2NKX8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERCC6LQ2NKX8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERCC6LQ2NKX8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERCC6LQ2NKX8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERCC6LQ2NKX8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERCC6LQ2NKX8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERCC6LQ2NKX8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERCC6LQ2NKX8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERCC6LQ2NKX8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERCC6LQ2NKX8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERCC6LQ2NKX8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERCC6LQ2NKX8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERCC6LQ2NKX8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ERCC6LQ2NKX8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERCC6LQ2NKX8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ERCC6LQ2NKX8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERCC6LQ2NKX8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERCC6LQ2NKX8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERCC6LQ2NKX8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERCC6LQ2NKX8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERCC6LQ2NKX8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERCC6LQ2NKX8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERCC6LQ2NKX8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERCC6LQ2NKX8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERCC6LQ2NKX8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERCC6LQ2NKX8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERCC6LQ2NKX8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERCC6LQ2NKX8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERCC6LQ2NKX8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERCC6LQ2NKX8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERCC6LQ2NKX8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ERCC6LQ2NKX8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERCC6LQ2NKX8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
ERCC6LQ2NKX8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ERCC6LQ2NKX8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ERCC6LQ2NKX8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ERCC6LQ2NKX8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ERCC6LQ2NKX8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ERCC6LQ2NKX8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ERCC6LQ2NKX8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ERCC6LQ2NKX8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.1 ms