Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MICAQ29983 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MICAQ29983 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MICAQ29983 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MICAQ29983 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MICAQ29983 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MICAQ29983 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MICAQ29983 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MICAQ29983 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MICAQ29983 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MICAQ29983 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MICAQ29983 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MICAQ29983 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MICAQ29983 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MICAQ29983 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MICAQ29983 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MICAQ29983 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MICAQ29983 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
MICAQ29983 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
MICAQ29983 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MICAQ29983 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MICAQ29983 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MICAQ29983 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MICAQ29983 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MICAQ29983 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MICAQ29983 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MICAQ29983 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MICAQ29983 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MICAQ29983 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MICAQ29983 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MICAQ29983 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MICAQ29983 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MICAQ29983 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MICAQ29983 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MICAQ29983 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MICAQ29983 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MICAQ29983 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MICAQ29983 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
MICAQ29983 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MICAQ29983 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MICAQ29983 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MICAQ29983 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MICAQ29983 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MICAQ29983 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MICAQ29983 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MICAQ29983 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MICAQ29983 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MICAQ29983 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MICAQ29983 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MICAQ29983 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MICAQ29983 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MICAQ29983 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MICAQ29983 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MICAQ29983 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MICAQ29983 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MICAQ29983 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MICAQ29983 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MICAQ29983 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MICAQ29983 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MICAQ29983 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MICAQ29983 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MICAQ29983 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MICAQ29983 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MICAQ29983 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MICAQ29983 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MICAQ29983 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MICAQ29983 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MICAQ29983 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MICAQ29983 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MICAQ29983 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MICAQ29983 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MICAQ29983 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MICAQ29983 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MICAQ29983 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MICAQ29983 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MICAQ29983 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MICAQ29983 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MICAQ29983 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MICAQ29983 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MICAQ29983 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
MICAQ29983 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MICAQ29983 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MICAQ29983 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MICAQ29983 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MICAQ29983 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MICAQ29983 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MICAQ29983 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MICAQ29983 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MICAQ29983 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MICAQ29983 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MICAQ29983 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MICAQ29983 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MICAQ29983 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MICAQ29983 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MICAQ29983 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MICAQ29983 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MICAQ29983 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MICAQ29983 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MICAQ29983 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MICAQ29983 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.9 ms