Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DUSP6Q16828 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DUSP6Q16828 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
DUSP6Q16828 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
DUSP6Q16828 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
DUSP6Q16828 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DUSP6Q16828 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DUSP6Q16828 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DUSP6Q16828 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DUSP6Q16828 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DUSP6Q16828 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DUSP6Q16828 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DUSP6Q16828 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DUSP6Q16828 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DUSP6Q16828 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DUSP6Q16828 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DUSP6Q16828 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DUSP6Q16828 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DUSP6Q16828 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DUSP6Q16828 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
DUSP6Q16828 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
DUSP6Q16828 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DUSP6Q16828 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DUSP6Q16828 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DUSP6Q16828 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DUSP6Q16828 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
DUSP6Q16828 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DUSP6Q16828 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DUSP6Q16828 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DUSP6Q16828 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DUSP6Q16828 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DUSP6Q16828 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DUSP6Q16828 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DUSP6Q16828 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DUSP6Q16828 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DUSP6Q16828 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
DUSP6Q16828 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DUSP6Q16828 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DUSP6Q16828 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DUSP6Q16828 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DUSP6Q16828 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DUSP6Q16828 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
DUSP6Q16828 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DUSP6Q16828 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DUSP6Q16828 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DUSP6Q16828 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DUSP6Q16828 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DUSP6Q16828 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DUSP6Q16828 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DUSP6Q16828 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DUSP6Q16828 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DUSP6Q16828 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DUSP6Q16828 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DUSP6Q16828 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DUSP6Q16828 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DUSP6Q16828 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DUSP6Q16828 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DUSP6Q16828 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DUSP6Q16828 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DUSP6Q16828 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DUSP6Q16828 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DUSP6Q16828 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DUSP6Q16828 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DUSP6Q16828 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DUSP6Q16828 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DUSP6Q16828 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DUSP6Q16828 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DUSP6Q16828 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DUSP6Q16828 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DUSP6Q16828 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DUSP6Q16828 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DUSP6Q16828 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DUSP6Q16828 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DUSP6Q16828 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DUSP6Q16828 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DUSP6Q16828 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DUSP6Q16828 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DUSP6Q16828 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DUSP6Q16828 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DUSP6Q16828 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DUSP6Q16828 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DUSP6Q16828 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DUSP6Q16828 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DUSP6Q16828 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DUSP6Q16828 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DUSP6Q16828 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DUSP6Q16828 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DUSP6Q16828 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DUSP6Q16828 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
DUSP6Q16828 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
DUSP6Q16828 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
DUSP6Q16828 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
DUSP6Q16828 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DUSP6Q16828 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DUSP6Q16828 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DUSP6Q16828 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DUSP6Q16828 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
DUSP6Q16828 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DUSP6Q16828 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
DUSP6Q16828 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
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