Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLPPQ16740 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLPPQ16740 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLPPQ16740 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLPPQ16740 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLPPQ16740 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLPPQ16740 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLPPQ16740 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLPPQ16740 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CLPPQ16740 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLPPQ16740 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLPPQ16740 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLPPQ16740 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLPPQ16740 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLPPQ16740 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLPPQ16740 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLPPQ16740 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLPPQ16740 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLPPQ16740 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLPPQ16740 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLPPQ16740 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLPPQ16740 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLPPQ16740 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLPPQ16740 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLPPQ16740 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLPPQ16740 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLPPQ16740 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLPPQ16740 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLPPQ16740 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLPPQ16740 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLPPQ16740 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLPPQ16740 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLPPQ16740 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLPPQ16740 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLPPQ16740 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLPPQ16740 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLPPQ16740 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLPPQ16740 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLPPQ16740 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CLPPQ16740 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLPPQ16740 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLPPQ16740 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLPPQ16740 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CLPPQ16740 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLPPQ16740 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLPPQ16740 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLPPQ16740 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLPPQ16740 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLPPQ16740 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLPPQ16740 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLPPQ16740 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLPPQ16740 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLPPQ16740 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLPPQ16740 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLPPQ16740 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLPPQ16740 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLPPQ16740 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLPPQ16740 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLPPQ16740 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLPPQ16740 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLPPQ16740 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CLPPQ16740 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLPPQ16740 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLPPQ16740 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLPPQ16740 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLPPQ16740 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLPPQ16740 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLPPQ16740 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLPPQ16740 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLPPQ16740 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLPPQ16740 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLPPQ16740 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLPPQ16740 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLPPQ16740 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLPPQ16740 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLPPQ16740 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLPPQ16740 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CLPPQ16740 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLPPQ16740 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLPPQ16740 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLPPQ16740 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLPPQ16740 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLPPQ16740 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLPPQ16740 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLPPQ16740 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLPPQ16740 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLPPQ16740 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CLPPQ16740 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLPPQ16740 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLPPQ16740 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLPPQ16740 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CLPPQ16740 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CLPPQ16740 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLPPQ16740 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLPPQ16740 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLPPQ16740 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLPPQ16740 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CLPPQ16740 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLPPQ16740 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLPPQ16740 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
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