Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATP2B3Q16720 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATP2B3Q16720 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATP2B3Q16720 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATP2B3Q16720 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATP2B3Q16720 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATP2B3Q16720 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATP2B3Q16720 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATP2B3Q16720 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
ATP2B3Q16720 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATP2B3Q16720 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATP2B3Q16720 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATP2B3Q16720 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATP2B3Q16720 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATP2B3Q16720 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATP2B3Q16720 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
ATP2B3Q16720 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
ATP2B3Q16720 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
ATP2B3Q16720 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ATP2B3Q16720 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ATP2B3Q16720 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ATP2B3Q16720 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ATP2B3Q16720 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ATP2B3Q16720 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ATP2B3Q16720 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ATP2B3Q16720 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ATP2B3Q16720 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATP2B3Q16720 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATP2B3Q16720 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATP2B3Q16720 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATP2B3Q16720 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATP2B3Q16720 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATP2B3Q16720 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATP2B3Q16720 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATP2B3Q16720 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATP2B3Q16720 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATP2B3Q16720 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATP2B3Q16720 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATP2B3Q16720 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATP2B3Q16720 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATP2B3Q16720 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATP2B3Q16720 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATP2B3Q16720 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATP2B3Q16720 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATP2B3Q16720 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
ATP2B3Q16720 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATP2B3Q16720 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATP2B3Q16720 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATP2B3Q16720 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATP2B3Q16720 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATP2B3Q16720 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATP2B3Q16720 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATP2B3Q16720 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATP2B3Q16720 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATP2B3Q16720 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATP2B3Q16720 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATP2B3Q16720 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
ATP2B3Q16720 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATP2B3Q16720 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATP2B3Q16720 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATP2B3Q16720 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATP2B3Q16720 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATP2B3Q16720 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATP2B3Q16720 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
ATP2B3Q16720 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATP2B3Q16720 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATP2B3Q16720 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATP2B3Q16720 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
ATP2B3Q16720 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
ATP2B3Q16720 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATP2B3Q16720 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATP2B3Q16720 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATP2B3Q16720 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATP2B3Q16720 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATP2B3Q16720 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATP2B3Q16720 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATP2B3Q16720 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATP2B3Q16720 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATP2B3Q16720 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATP2B3Q16720 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATP2B3Q16720 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATP2B3Q16720 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATP2B3Q16720 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
ATP2B3Q16720 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATP2B3Q16720 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATP2B3Q16720 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATP2B3Q16720 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATP2B3Q16720 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATP2B3Q16720 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATP2B3Q16720 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATP2B3Q16720 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATP2B3Q16720 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATP2B3Q16720 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
ATP2B3Q16720 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATP2B3Q16720 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATP2B3Q16720 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATP2B3Q16720 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATP2B3Q16720 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATP2B3Q16720 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATP2B3Q16720 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms