Protein–RNA interactions for Protein: Q16650

TBR1, T-box brain protein 1, humanhuman

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Length 682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBR1Q16650 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TBR1Q16650 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TBR1Q16650 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TBR1Q16650 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TBR1Q16650 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TBR1Q16650 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TBR1Q16650 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TBR1Q16650 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TBR1Q16650 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TBR1Q16650 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TBR1Q16650 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TBR1Q16650 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TBR1Q16650 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TBR1Q16650 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TBR1Q16650 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TBR1Q16650 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TBR1Q16650 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TBR1Q16650 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TBR1Q16650 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TBR1Q16650 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TBR1Q16650 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TBR1Q16650 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TBR1Q16650 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TBR1Q16650 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TBR1Q16650 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TBR1Q16650 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TBR1Q16650 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TBR1Q16650 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TBR1Q16650 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TBR1Q16650 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TBR1Q16650 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TBR1Q16650 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TBR1Q16650 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TBR1Q16650 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TBR1Q16650 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TBR1Q16650 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TBR1Q16650 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TBR1Q16650 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TBR1Q16650 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TBR1Q16650 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TBR1Q16650 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TBR1Q16650 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TBR1Q16650 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TBR1Q16650 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TBR1Q16650 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TBR1Q16650 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TBR1Q16650 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TBR1Q16650 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TBR1Q16650 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TBR1Q16650 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TBR1Q16650 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TBR1Q16650 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TBR1Q16650 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TBR1Q16650 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TBR1Q16650 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TBR1Q16650 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TBR1Q16650 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TBR1Q16650 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TBR1Q16650 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TBR1Q16650 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TBR1Q16650 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TBR1Q16650 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TBR1Q16650 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TBR1Q16650 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TBR1Q16650 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TBR1Q16650 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TBR1Q16650 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TBR1Q16650 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TBR1Q16650 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TBR1Q16650 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TBR1Q16650 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TBR1Q16650 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TBR1Q16650 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TBR1Q16650 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TBR1Q16650 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TBR1Q16650 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TBR1Q16650 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TBR1Q16650 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TBR1Q16650 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TBR1Q16650 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TBR1Q16650 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TBR1Q16650 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TBR1Q16650 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TBR1Q16650 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TBR1Q16650 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TBR1Q16650 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TBR1Q16650 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TBR1Q16650 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TBR1Q16650 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TBR1Q16650 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TBR1Q16650 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TBR1Q16650 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TBR1Q16650 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TBR1Q16650 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TBR1Q16650 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TBR1Q16650 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TBR1Q16650 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TBR1Q16650 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TBR1Q16650 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TBR1Q16650 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
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