Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FXNQ16595 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FXNQ16595 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FXNQ16595 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FXNQ16595 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FXNQ16595 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FXNQ16595 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FXNQ16595 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FXNQ16595 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FXNQ16595 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FXNQ16595 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FXNQ16595 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FXNQ16595 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FXNQ16595 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FXNQ16595 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FXNQ16595 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FXNQ16595 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FXNQ16595 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FXNQ16595 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FXNQ16595 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FXNQ16595 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FXNQ16595 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FXNQ16595 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FXNQ16595 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FXNQ16595 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FXNQ16595 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FXNQ16595 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FXNQ16595 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FXNQ16595 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FXNQ16595 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FXNQ16595 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FXNQ16595 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FXNQ16595 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FXNQ16595 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FXNQ16595 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FXNQ16595 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FXNQ16595 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FXNQ16595 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FXNQ16595 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FXNQ16595 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FXNQ16595 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FXNQ16595 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FXNQ16595 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FXNQ16595 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FXNQ16595 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FXNQ16595 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FXNQ16595 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FXNQ16595 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FXNQ16595 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FXNQ16595 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FXNQ16595 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FXNQ16595 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FXNQ16595 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FXNQ16595 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FXNQ16595 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FXNQ16595 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FXNQ16595 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FXNQ16595 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FXNQ16595 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FXNQ16595 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FXNQ16595 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FXNQ16595 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FXNQ16595 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FXNQ16595 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FXNQ16595 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FXNQ16595 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FXNQ16595 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FXNQ16595 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FXNQ16595 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FXNQ16595 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FXNQ16595 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FXNQ16595 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FXNQ16595 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FXNQ16595 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FXNQ16595 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FXNQ16595 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FXNQ16595 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FXNQ16595 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FXNQ16595 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FXNQ16595 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FXNQ16595 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FXNQ16595 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FXNQ16595 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FXNQ16595 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FXNQ16595 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FXNQ16595 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FXNQ16595 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FXNQ16595 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FXNQ16595 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FXNQ16595 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FXNQ16595 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FXNQ16595 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FXNQ16595 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FXNQ16595 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FXNQ16595 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FXNQ16595 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FXNQ16595 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FXNQ16595 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FXNQ16595 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FXNQ16595 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
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