Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

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Length 942 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PKN1Q16512 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PKN1Q16512 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PKN1Q16512 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PKN1Q16512 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PKN1Q16512 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PKN1Q16512 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PKN1Q16512 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PKN1Q16512 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PKN1Q16512 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PKN1Q16512 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PKN1Q16512 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PKN1Q16512 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PKN1Q16512 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PKN1Q16512 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PKN1Q16512 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PKN1Q16512 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PKN1Q16512 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PKN1Q16512 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PKN1Q16512 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PKN1Q16512 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PKN1Q16512 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PKN1Q16512 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PKN1Q16512 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PKN1Q16512 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PKN1Q16512 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PKN1Q16512 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PKN1Q16512 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PKN1Q16512 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PKN1Q16512 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PKN1Q16512 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PKN1Q16512 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PKN1Q16512 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PKN1Q16512 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PKN1Q16512 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PKN1Q16512 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PKN1Q16512 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PKN1Q16512 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PKN1Q16512 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PKN1Q16512 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PKN1Q16512 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PKN1Q16512 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PKN1Q16512 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PKN1Q16512 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PKN1Q16512 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PKN1Q16512 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PKN1Q16512 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PKN1Q16512 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PKN1Q16512 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PKN1Q16512 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PKN1Q16512 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PKN1Q16512 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PKN1Q16512 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PKN1Q16512 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PKN1Q16512 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PKN1Q16512 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PKN1Q16512 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PKN1Q16512 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PKN1Q16512 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PKN1Q16512 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PKN1Q16512 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PKN1Q16512 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PKN1Q16512 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PKN1Q16512 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PKN1Q16512 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PKN1Q16512 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PKN1Q16512 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PKN1Q16512 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PKN1Q16512 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PKN1Q16512 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PKN1Q16512 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PKN1Q16512 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PKN1Q16512 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PKN1Q16512 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PKN1Q16512 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PKN1Q16512 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PKN1Q16512 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PKN1Q16512 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PKN1Q16512 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PKN1Q16512 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PKN1Q16512 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PKN1Q16512 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PKN1Q16512 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PKN1Q16512 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PKN1Q16512 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PKN1Q16512 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PKN1Q16512 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PKN1Q16512 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PKN1Q16512 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PKN1Q16512 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PKN1Q16512 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PKN1Q16512 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PKN1Q16512 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PKN1Q16512 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PKN1Q16512 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PKN1Q16512 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PKN1Q16512 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PKN1Q16512 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PKN1Q16512 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PKN1Q16512 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
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