Protein–RNA interactions for Protein: Q15653

NFKBIB, NF-kappa-B inhibitor beta, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIBQ15653 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NFKBIBQ15653 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NFKBIBQ15653 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NFKBIBQ15653 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NFKBIBQ15653 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NFKBIBQ15653 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NFKBIBQ15653 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NFKBIBQ15653 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NFKBIBQ15653 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NFKBIBQ15653 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NFKBIBQ15653 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NFKBIBQ15653 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
NFKBIBQ15653 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NFKBIBQ15653 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NFKBIBQ15653 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NFKBIBQ15653 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NFKBIBQ15653 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NFKBIBQ15653 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NFKBIBQ15653 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NFKBIBQ15653 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NFKBIBQ15653 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NFKBIBQ15653 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NFKBIBQ15653 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NFKBIBQ15653 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
NFKBIBQ15653 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NFKBIBQ15653 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NFKBIBQ15653 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NFKBIBQ15653 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NFKBIBQ15653 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NFKBIBQ15653 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NFKBIBQ15653 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NFKBIBQ15653 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NFKBIBQ15653 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NFKBIBQ15653 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NFKBIBQ15653 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NFKBIBQ15653 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NFKBIBQ15653 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NFKBIBQ15653 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NFKBIBQ15653 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NFKBIBQ15653 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NFKBIBQ15653 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NFKBIBQ15653 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NFKBIBQ15653 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NFKBIBQ15653 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NFKBIBQ15653 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NFKBIBQ15653 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NFKBIBQ15653 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NFKBIBQ15653 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NFKBIBQ15653 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NFKBIBQ15653 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NFKBIBQ15653 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms