Protein–RNA interactions for Protein: Q15526

SURF1, Surfeit locus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF1Q15526 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SURF1Q15526 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SURF1Q15526 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SURF1Q15526 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SURF1Q15526 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SURF1Q15526 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SURF1Q15526 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SURF1Q15526 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SURF1Q15526 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SURF1Q15526 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SURF1Q15526 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SURF1Q15526 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SURF1Q15526 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SURF1Q15526 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SURF1Q15526 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SURF1Q15526 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SURF1Q15526 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SURF1Q15526 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SURF1Q15526 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SURF1Q15526 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SURF1Q15526 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SURF1Q15526 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SURF1Q15526 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SURF1Q15526 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SURF1Q15526 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SURF1Q15526 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SURF1Q15526 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SURF1Q15526 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SURF1Q15526 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SURF1Q15526 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SURF1Q15526 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SURF1Q15526 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SURF1Q15526 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SURF1Q15526 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SURF1Q15526 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SURF1Q15526 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SURF1Q15526 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SURF1Q15526 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SURF1Q15526 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SURF1Q15526 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SURF1Q15526 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SURF1Q15526 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SURF1Q15526 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SURF1Q15526 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SURF1Q15526 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SURF1Q15526 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SURF1Q15526 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SURF1Q15526 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SURF1Q15526 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SURF1Q15526 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SURF1Q15526 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SURF1Q15526 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SURF1Q15526 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SURF1Q15526 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SURF1Q15526 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SURF1Q15526 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SURF1Q15526 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SURF1Q15526 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SURF1Q15526 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SURF1Q15526 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SURF1Q15526 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SURF1Q15526 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SURF1Q15526 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
SURF1Q15526 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SURF1Q15526 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SURF1Q15526 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SURF1Q15526 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SURF1Q15526 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SURF1Q15526 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SURF1Q15526 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SURF1Q15526 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SURF1Q15526 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SURF1Q15526 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SURF1Q15526 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SURF1Q15526 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SURF1Q15526 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SURF1Q15526 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SURF1Q15526 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SURF1Q15526 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SURF1Q15526 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SURF1Q15526 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SURF1Q15526 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SURF1Q15526 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SURF1Q15526 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SURF1Q15526 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SURF1Q15526 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SURF1Q15526 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SURF1Q15526 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SURF1Q15526 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SURF1Q15526 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SURF1Q15526 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SURF1Q15526 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SURF1Q15526 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SURF1Q15526 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SURF1Q15526 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SURF1Q15526 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SURF1Q15526 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SURF1Q15526 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SURF1Q15526 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SURF1Q15526 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
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