Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDSNQ15517 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDSNQ15517 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDSNQ15517 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDSNQ15517 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDSNQ15517 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDSNQ15517 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDSNQ15517 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDSNQ15517 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CDSNQ15517 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDSNQ15517 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDSNQ15517 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDSNQ15517 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDSNQ15517 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDSNQ15517 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CDSNQ15517 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDSNQ15517 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CDSNQ15517 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CDSNQ15517 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CDSNQ15517 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDSNQ15517 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CDSNQ15517 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDSNQ15517 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDSNQ15517 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDSNQ15517 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDSNQ15517 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDSNQ15517 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDSNQ15517 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDSNQ15517 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDSNQ15517 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDSNQ15517 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDSNQ15517 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDSNQ15517 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDSNQ15517 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDSNQ15517 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDSNQ15517 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDSNQ15517 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CDSNQ15517 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDSNQ15517 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CDSNQ15517 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDSNQ15517 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDSNQ15517 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDSNQ15517 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDSNQ15517 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDSNQ15517 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDSNQ15517 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDSNQ15517 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CDSNQ15517 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDSNQ15517 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDSNQ15517 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDSNQ15517 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDSNQ15517 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CDSNQ15517 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDSNQ15517 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CDSNQ15517 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDSNQ15517 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDSNQ15517 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDSNQ15517 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDSNQ15517 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDSNQ15517 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDSNQ15517 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDSNQ15517 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDSNQ15517 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDSNQ15517 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDSNQ15517 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDSNQ15517 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDSNQ15517 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDSNQ15517 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CDSNQ15517 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDSNQ15517 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CDSNQ15517 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDSNQ15517 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDSNQ15517 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDSNQ15517 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDSNQ15517 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDSNQ15517 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDSNQ15517 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDSNQ15517 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDSNQ15517 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDSNQ15517 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDSNQ15517 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDSNQ15517 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDSNQ15517 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDSNQ15517 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDSNQ15517 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDSNQ15517 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDSNQ15517 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDSNQ15517 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDSNQ15517 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDSNQ15517 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDSNQ15517 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDSNQ15517 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDSNQ15517 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDSNQ15517 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDSNQ15517 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CDSNQ15517 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDSNQ15517 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDSNQ15517 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDSNQ15517 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDSNQ15517 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms