Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SKIV2LQ15477 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SKIV2LQ15477 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SKIV2LQ15477 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SKIV2LQ15477 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SKIV2LQ15477 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SKIV2LQ15477 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SKIV2LQ15477 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SKIV2LQ15477 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SKIV2LQ15477 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SKIV2LQ15477 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SKIV2LQ15477 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SKIV2LQ15477 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SKIV2LQ15477 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SKIV2LQ15477 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SKIV2LQ15477 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SKIV2LQ15477 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SKIV2LQ15477 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SKIV2LQ15477 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SKIV2LQ15477 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SKIV2LQ15477 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SKIV2LQ15477 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SKIV2LQ15477 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SKIV2LQ15477 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SKIV2LQ15477 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SKIV2LQ15477 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SKIV2LQ15477 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SKIV2LQ15477 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SKIV2LQ15477 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SKIV2LQ15477 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SKIV2LQ15477 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SKIV2LQ15477 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SKIV2LQ15477 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SKIV2LQ15477 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SKIV2LQ15477 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SKIV2LQ15477 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SKIV2LQ15477 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SKIV2LQ15477 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SKIV2LQ15477 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SKIV2LQ15477 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SKIV2LQ15477 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
SKIV2LQ15477 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SKIV2LQ15477 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SKIV2LQ15477 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SKIV2LQ15477 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SKIV2LQ15477 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SKIV2LQ15477 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SKIV2LQ15477 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SKIV2LQ15477 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SKIV2LQ15477 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SKIV2LQ15477 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SKIV2LQ15477 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SKIV2LQ15477 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SKIV2LQ15477 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SKIV2LQ15477 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SKIV2LQ15477 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SKIV2LQ15477 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SKIV2LQ15477 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SKIV2LQ15477 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SKIV2LQ15477 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SKIV2LQ15477 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SKIV2LQ15477 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SKIV2LQ15477 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SKIV2LQ15477 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SKIV2LQ15477 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SKIV2LQ15477 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SKIV2LQ15477 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SKIV2LQ15477 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SKIV2LQ15477 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SKIV2LQ15477 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SKIV2LQ15477 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SKIV2LQ15477 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SKIV2LQ15477 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SKIV2LQ15477 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SKIV2LQ15477 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SKIV2LQ15477 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SKIV2LQ15477 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SKIV2LQ15477 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SKIV2LQ15477 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SKIV2LQ15477 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SKIV2LQ15477 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SKIV2LQ15477 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SKIV2LQ15477 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SKIV2LQ15477 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SKIV2LQ15477 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SKIV2LQ15477 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SKIV2LQ15477 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SKIV2LQ15477 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SKIV2LQ15477 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SKIV2LQ15477 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SKIV2LQ15477 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SKIV2LQ15477 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SKIV2LQ15477 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SKIV2LQ15477 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SKIV2LQ15477 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SKIV2LQ15477 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SKIV2LQ15477 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SKIV2LQ15477 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SKIV2LQ15477 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SKIV2LQ15477 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms