Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SEC23BQ15437 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEC23BQ15437 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEC23BQ15437 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEC23BQ15437 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEC23BQ15437 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEC23BQ15437 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEC23BQ15437 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEC23BQ15437 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEC23BQ15437 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEC23BQ15437 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEC23BQ15437 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEC23BQ15437 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEC23BQ15437 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEC23BQ15437 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEC23BQ15437 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEC23BQ15437 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEC23BQ15437 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEC23BQ15437 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEC23BQ15437 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEC23BQ15437 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEC23BQ15437 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEC23BQ15437 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEC23BQ15437 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEC23BQ15437 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEC23BQ15437 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEC23BQ15437 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SEC23BQ15437 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEC23BQ15437 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SEC23BQ15437 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEC23BQ15437 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEC23BQ15437 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEC23BQ15437 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEC23BQ15437 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEC23BQ15437 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEC23BQ15437 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEC23BQ15437 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEC23BQ15437 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEC23BQ15437 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEC23BQ15437 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEC23BQ15437 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEC23BQ15437 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEC23BQ15437 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEC23BQ15437 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEC23BQ15437 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEC23BQ15437 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEC23BQ15437 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEC23BQ15437 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEC23BQ15437 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEC23BQ15437 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEC23BQ15437 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEC23BQ15437 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEC23BQ15437 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEC23BQ15437 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEC23BQ15437 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEC23BQ15437 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEC23BQ15437 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEC23BQ15437 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEC23BQ15437 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEC23BQ15437 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEC23BQ15437 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SEC23BQ15437 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEC23BQ15437 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEC23BQ15437 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEC23BQ15437 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEC23BQ15437 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEC23BQ15437 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEC23BQ15437 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEC23BQ15437 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEC23BQ15437 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEC23BQ15437 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEC23BQ15437 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEC23BQ15437 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SEC23BQ15437 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEC23BQ15437 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEC23BQ15437 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEC23BQ15437 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEC23BQ15437 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEC23BQ15437 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEC23BQ15437 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEC23BQ15437 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEC23BQ15437 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEC23BQ15437 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEC23BQ15437 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEC23BQ15437 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEC23BQ15437 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEC23BQ15437 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEC23BQ15437 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEC23BQ15437 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEC23BQ15437 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEC23BQ15437 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEC23BQ15437 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEC23BQ15437 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEC23BQ15437 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEC23BQ15437 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEC23BQ15437 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEC23BQ15437 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEC23BQ15437 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEC23BQ15437 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEC23BQ15437 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
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