Protein–RNA interactions for Protein: Q15418

RPS6KA1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA1Q15418 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPS6KA1Q15418 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPS6KA1Q15418 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPS6KA1Q15418 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPS6KA1Q15418 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPS6KA1Q15418 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RPS6KA1Q15418 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPS6KA1Q15418 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPS6KA1Q15418 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPS6KA1Q15418 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPS6KA1Q15418 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPS6KA1Q15418 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPS6KA1Q15418 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPS6KA1Q15418 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPS6KA1Q15418 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPS6KA1Q15418 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPS6KA1Q15418 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPS6KA1Q15418 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPS6KA1Q15418 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPS6KA1Q15418 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPS6KA1Q15418 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPS6KA1Q15418 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPS6KA1Q15418 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPS6KA1Q15418 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPS6KA1Q15418 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPS6KA1Q15418 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPS6KA1Q15418 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPS6KA1Q15418 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPS6KA1Q15418 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPS6KA1Q15418 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPS6KA1Q15418 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPS6KA1Q15418 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPS6KA1Q15418 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPS6KA1Q15418 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPS6KA1Q15418 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPS6KA1Q15418 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RPS6KA1Q15418 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPS6KA1Q15418 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPS6KA1Q15418 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPS6KA1Q15418 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPS6KA1Q15418 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPS6KA1Q15418 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPS6KA1Q15418 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPS6KA1Q15418 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPS6KA1Q15418 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPS6KA1Q15418 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPS6KA1Q15418 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPS6KA1Q15418 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPS6KA1Q15418 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPS6KA1Q15418 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPS6KA1Q15418 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RPS6KA1Q15418 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPS6KA1Q15418 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPS6KA1Q15418 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPS6KA1Q15418 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPS6KA1Q15418 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPS6KA1Q15418 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPS6KA1Q15418 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPS6KA1Q15418 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPS6KA1Q15418 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPS6KA1Q15418 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPS6KA1Q15418 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPS6KA1Q15418 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPS6KA1Q15418 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPS6KA1Q15418 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPS6KA1Q15418 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPS6KA1Q15418 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPS6KA1Q15418 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPS6KA1Q15418 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPS6KA1Q15418 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPS6KA1Q15418 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RPS6KA1Q15418 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RPS6KA1Q15418 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPS6KA1Q15418 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPS6KA1Q15418 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPS6KA1Q15418 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPS6KA1Q15418 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPS6KA1Q15418 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPS6KA1Q15418 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPS6KA1Q15418 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPS6KA1Q15418 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPS6KA1Q15418 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPS6KA1Q15418 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPS6KA1Q15418 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPS6KA1Q15418 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPS6KA1Q15418 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPS6KA1Q15418 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPS6KA1Q15418 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RPS6KA1Q15418 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RPS6KA1Q15418 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RPS6KA1Q15418 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPS6KA1Q15418 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPS6KA1Q15418 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPS6KA1Q15418 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPS6KA1Q15418 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPS6KA1Q15418 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPS6KA1Q15418 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPS6KA1Q15418 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPS6KA1Q15418 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPS6KA1Q15418 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
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