Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TTF1Q15361 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TTF1Q15361 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TTF1Q15361 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TTF1Q15361 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TTF1Q15361 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TTF1Q15361 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TTF1Q15361 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TTF1Q15361 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TTF1Q15361 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TTF1Q15361 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TTF1Q15361 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TTF1Q15361 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TTF1Q15361 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TTF1Q15361 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TTF1Q15361 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TTF1Q15361 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TTF1Q15361 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TTF1Q15361 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
TTF1Q15361 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
TTF1Q15361 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
TTF1Q15361 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
TTF1Q15361 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TTF1Q15361 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TTF1Q15361 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TTF1Q15361 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TTF1Q15361 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TTF1Q15361 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TTF1Q15361 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TTF1Q15361 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TTF1Q15361 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TTF1Q15361 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TTF1Q15361 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TTF1Q15361 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TTF1Q15361 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TTF1Q15361 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TTF1Q15361 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TTF1Q15361 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
TTF1Q15361 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TTF1Q15361 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TTF1Q15361 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TTF1Q15361 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TTF1Q15361 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TTF1Q15361 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TTF1Q15361 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TTF1Q15361 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TTF1Q15361 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TTF1Q15361 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TTF1Q15361 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TTF1Q15361 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TTF1Q15361 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TTF1Q15361 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TTF1Q15361 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TTF1Q15361 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TTF1Q15361 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TTF1Q15361 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TTF1Q15361 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TTF1Q15361 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TTF1Q15361 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TTF1Q15361 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TTF1Q15361 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TTF1Q15361 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TTF1Q15361 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
TTF1Q15361 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TTF1Q15361 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TTF1Q15361 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TTF1Q15361 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TTF1Q15361 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TTF1Q15361 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TTF1Q15361 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
TTF1Q15361 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TTF1Q15361 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TTF1Q15361 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TTF1Q15361 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TTF1Q15361 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TTF1Q15361 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
TTF1Q15361 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TTF1Q15361 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
TTF1Q15361 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TTF1Q15361 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TTF1Q15361 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TTF1Q15361 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TTF1Q15361 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TTF1Q15361 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TTF1Q15361 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TTF1Q15361 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TTF1Q15361 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TTF1Q15361 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TTF1Q15361 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TTF1Q15361 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TTF1Q15361 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TTF1Q15361 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TTF1Q15361 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TTF1Q15361 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TTF1Q15361 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TTF1Q15361 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TTF1Q15361 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TTF1Q15361 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TTF1Q15361 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TTF1Q15361 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
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