Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB35Q15286 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB35Q15286 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB35Q15286 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RAB35Q15286 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RAB35Q15286 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
RAB35Q15286 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RAB35Q15286 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB35Q15286 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB35Q15286 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB35Q15286 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB35Q15286 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB35Q15286 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB35Q15286 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB35Q15286 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB35Q15286 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB35Q15286 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB35Q15286 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB35Q15286 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB35Q15286 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB35Q15286 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB35Q15286 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB35Q15286 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB35Q15286 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB35Q15286 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB35Q15286 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB35Q15286 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB35Q15286 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB35Q15286 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB35Q15286 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB35Q15286 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB35Q15286 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB35Q15286 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB35Q15286 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB35Q15286 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB35Q15286 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB35Q15286 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB35Q15286 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB35Q15286 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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RAB35Q15286 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
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RAB35Q15286 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB35Q15286 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
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RAB35Q15286 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RAB35Q15286 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RAB35Q15286 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
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RAB35Q15286 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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RAB35Q15286 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB35Q15286 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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RAB35Q15286 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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RAB35Q15286 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB35Q15286 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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RAB35Q15286 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB35Q15286 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB35Q15286 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB35Q15286 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB35Q15286 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB35Q15286 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB35Q15286 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB35Q15286 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB35Q15286 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB35Q15286 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB35Q15286 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB35Q15286 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB35Q15286 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB35Q15286 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB35Q15286 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB35Q15286 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB35Q15286 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB35Q15286 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB35Q15286 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB35Q15286 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB35Q15286 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB35Q15286 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB35Q15286 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB35Q15286 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB35Q15286 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB35Q15286 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB35Q15286 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
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