Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RABEP1Q15276 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RABEP1Q15276 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
RABEP1Q15276 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RABEP1Q15276 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RABEP1Q15276 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RABEP1Q15276 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RABEP1Q15276 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RABEP1Q15276 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RABEP1Q15276 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RABEP1Q15276 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RABEP1Q15276 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RABEP1Q15276 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RABEP1Q15276 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RABEP1Q15276 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RABEP1Q15276 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RABEP1Q15276 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RABEP1Q15276 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RABEP1Q15276 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RABEP1Q15276 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RABEP1Q15276 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RABEP1Q15276 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RABEP1Q15276 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RABEP1Q15276 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RABEP1Q15276 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RABEP1Q15276 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RABEP1Q15276 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RABEP1Q15276 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RABEP1Q15276 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RABEP1Q15276 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RABEP1Q15276 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RABEP1Q15276 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RABEP1Q15276 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RABEP1Q15276 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RABEP1Q15276 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RABEP1Q15276 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RABEP1Q15276 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RABEP1Q15276 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RABEP1Q15276 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RABEP1Q15276 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
RABEP1Q15276 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RABEP1Q15276 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RABEP1Q15276 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
RABEP1Q15276 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RABEP1Q15276 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RABEP1Q15276 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RABEP1Q15276 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RABEP1Q15276 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RABEP1Q15276 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RABEP1Q15276 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
RABEP1Q15276 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RABEP1Q15276 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RABEP1Q15276 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RABEP1Q15276 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RABEP1Q15276 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RABEP1Q15276 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RABEP1Q15276 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RABEP1Q15276 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RABEP1Q15276 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RABEP1Q15276 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RABEP1Q15276 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RABEP1Q15276 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RABEP1Q15276 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RABEP1Q15276 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
RABEP1Q15276 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RABEP1Q15276 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RABEP1Q15276 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RABEP1Q15276 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RABEP1Q15276 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RABEP1Q15276 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RABEP1Q15276 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RABEP1Q15276 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RABEP1Q15276 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RABEP1Q15276 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RABEP1Q15276 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RABEP1Q15276 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RABEP1Q15276 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RABEP1Q15276 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RABEP1Q15276 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RABEP1Q15276 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RABEP1Q15276 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RABEP1Q15276 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RABEP1Q15276 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RABEP1Q15276 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RABEP1Q15276 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RABEP1Q15276 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RABEP1Q15276 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RABEP1Q15276 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RABEP1Q15276 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RABEP1Q15276 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
RABEP1Q15276 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RABEP1Q15276 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
RABEP1Q15276 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RABEP1Q15276 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RABEP1Q15276 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RABEP1Q15276 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RABEP1Q15276 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RABEP1Q15276 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RABEP1Q15276 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RABEP1Q15276 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms