Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODF1Q14990 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODF1Q14990 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODF1Q14990 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODF1Q14990 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODF1Q14990 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODF1Q14990 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODF1Q14990 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF1Q14990 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF1Q14990 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF1Q14990 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF1Q14990 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF1Q14990 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF1Q14990 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF1Q14990 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ODF1Q14990 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ODF1Q14990 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF1Q14990 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF1Q14990 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF1Q14990 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF1Q14990 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF1Q14990 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF1Q14990 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF1Q14990 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF1Q14990 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF1Q14990 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF1Q14990 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF1Q14990 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF1Q14990 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODF1Q14990 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODF1Q14990 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ODF1Q14990 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODF1Q14990 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODF1Q14990 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODF1Q14990 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODF1Q14990 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODF1Q14990 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODF1Q14990 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODF1Q14990 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODF1Q14990 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODF1Q14990 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODF1Q14990 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODF1Q14990 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODF1Q14990 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODF1Q14990 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODF1Q14990 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODF1Q14990 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODF1Q14990 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODF1Q14990 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF1Q14990 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF1Q14990 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF1Q14990 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF1Q14990 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF1Q14990 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF1Q14990 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF1Q14990 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF1Q14990 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF1Q14990 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF1Q14990 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF1Q14990 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF1Q14990 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF1Q14990 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF1Q14990 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF1Q14990 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF1Q14990 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF1Q14990 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF1Q14990 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF1Q14990 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF1Q14990 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF1Q14990 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF1Q14990 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF1Q14990 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF1Q14990 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF1Q14990 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF1Q14990 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF1Q14990 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF1Q14990 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF1Q14990 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF1Q14990 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF1Q14990 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF1Q14990 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF1Q14990 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF1Q14990 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF1Q14990 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF1Q14990 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF1Q14990 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF1Q14990 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF1Q14990 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF1Q14990 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF1Q14990 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF1Q14990 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF1Q14990 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF1Q14990 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF1Q14990 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF1Q14990 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF1Q14990 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF1Q14990 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF1Q14990 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF1Q14990 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF1Q14990 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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